90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1370 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1370  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  594  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003231  hypothetical protein  84.15 
 
 		 284 aa  504  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01687  hypothetical protein  80.63 
 
 		 284 aa  483  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1262  hypothetical protein  73.24 
 
 		 287 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0111  hypothetical protein  48.56 
 
 		 326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4760  transcriptional regulator  47.33 
 
 		 291 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4623  transcriptional regulator-like protein  46.98 
 
 		 291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2844  decreased coverage  0.00000000441914 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2465  hypothetical protein  48.89 
 
 		 298 aa  266  4e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107107  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2478  hypothetical protein  46.95 
 
 		 285 aa  265  5e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.452915  normal  0.259065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2063  transcriptional regulator  46.98 
 
 		 290 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.754064  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2094  hypothetical protein  40.35 
 
 		 303 aa  223  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100358 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3550  hypothetical protein  39.05 
 
 		 275 aa  205  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.103965 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00864  predicted transcriptional regulator i A1501  34.93 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0550  transcriptional regulator  34.16 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1356  hypothetical protein  35.61 
 
 		 298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1284  hypothetical protein  36.82 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218684 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2716  hypothetical protein  35.51 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6051  hypothetical protein  48.75 
 
 		 280 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1844  hypothetical protein  34.29 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2176  hypothetical protein  34.83 
 
 		 289 aa  155  8e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00706566  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0913  hypothetical protein  35.77 
 
 		 279 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1529  hypothetical protein  32.86 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0282  hypothetical protein  33.92 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4196  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 298 aa  149  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1239  hypothetical protein  32.86 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3042  hypothetical protein  32.03 
 
 		 300 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2742  hypothetical protein  32.03 
 
 		 300 aa  145  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2604  hypothetical protein  32.03 
 
 		 300 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3737  hypothetical protein  31.65 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3103  hypothetical protein  32.12 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2085  hypothetical protein  32.61 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.069658 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0159  hypothetical protein  30.04 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.233345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2196  hypothetical protein  31.23 
 
 		 296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000497244  hitchhiker  0.00000469474 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0988  hypothetical protein  32.75 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4605  hypothetical protein  31.79 
 
 		 294 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2091  hypothetical protein  33.21 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0195  hypothetical protein  29.96 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0679  hypothetical protein  30.32 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11701  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2987  hypothetical protein  30.25 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.387576  normal  0.124084 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4284  hypothetical protein  31.41 
 
 		 289 aa  122  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0122  hypothetical protein  30.28 
 
 		 312 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6538  hypothetical protein  32.78 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4812  hypothetical protein  30.65 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0660  hypothetical protein  31.97 
 
 		 301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.125949  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01226  hypothetical protein  30.63 
 
 		 295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6931  hypothetical protein  32.97 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2014  hypothetical protein  30.77 
 
 		 302 aa  112  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04050  hypothetical protein  45.69 
 
 		 122 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.280957  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0289  hypothetical protein  29.09 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3596  hypothetical protein  30.71 
 
 		 288 aa  106  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1781  hypothetical protein  28.2 
 
 		 293 aa  105  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0419  hypothetical protein  28.78 
 
 		 294 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2419  hypothetical protein  30.83 
 
 		 299 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2028  hypothetical protein  28.21 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000322678  normal  0.839611 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2674  hypothetical protein  26.35 
 
 		 290 aa  95.5  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00152058  normal  0.0371695 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3177  hypothetical protein  28.3 
 
 		 305 aa  90.1  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4208  hypothetical protein  27.92 
 
 		 302 aa  89  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2140  hypothetical protein  27.11 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000023466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3185  transcriptional regulator-like  29.41 
 
 		 254 aa  85.5  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1442  hypothetical protein  28.27 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.37014  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0112  hypothetical protein  27.1 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2190  hypothetical protein  26.5 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.315226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.71 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  35.71 
 
 		 324 aa  52.4  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  22.11 
 
 		 350 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  20.63 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000116568 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3553  helix-turn-helix, type 11  35.63 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  24.34 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1880  hypothetical protein  35.29 
 
 		 344 aa  47  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4041  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.71 
 
 		 316 aa  46.2  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.24 
 
 		 324 aa  46.2  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2996  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.43 
 
 		 226 aa  46.2  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_30  hypothetical protein  36.36 
 
 		 96 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3900  hypothetical protein  32.84 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.82 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0108  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  34.85 
 
 		 240 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403778 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3428  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.55 
 
 		 303 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  39.68 
 
 		 336 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.26 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5238  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0249  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  36.76 
 
 		 324 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  31.08 
 
 		 325 aa  43.5  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0049  hypothetical protein  26.74 
 
 		 320 aa  43.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.607165  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  34.92 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2057  transcriptional regulator-like protein  34.92 
 
 		 320 aa  42.7  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090135  normal  0.188447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0920  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.33 
 
 		 327 aa  42.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.711136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1870  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  36.92 
 
 		 337 aa  42.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2874  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  32.31 
 
 		 322 aa  42.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 231 aa  42.4  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  33.87 
 
 		 313 aa  42.4  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>