69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2094 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2094  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  634    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4623  transcriptional regulator-like protein  44.88 
 
 		 291 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2844  decreased coverage  0.00000000441914 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4760  transcriptional regulator  44.88 
 
 		 291 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1262  hypothetical protein  42.61 
 
 		 287 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2063  transcriptional regulator  42.91 
 
 		 290 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.754064  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003231  hypothetical protein  40.14 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1370  hypothetical protein  40.35 
 
 		 286 aa  223  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0111  hypothetical protein  42.65 
 
 		 326 aa  221  9e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2465  hypothetical protein  42.38 
 
 		 298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107107  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2478  hypothetical protein  41.57 
 
 		 285 aa  218  7.999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.452915  normal  0.259065 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01687  hypothetical protein  38.38 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00864  predicted transcriptional regulator i A1501  32.73 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3550  hypothetical protein  35.13 
 
 		 275 aa  165  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.103965 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0913  hypothetical protein  34.17 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1529  hypothetical protein  33.21 
 
 		 295 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1844  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3737  hypothetical protein  32.97 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3103  hypothetical protein  34.05 
 
 		 282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2716  hypothetical protein  30.27 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1356  hypothetical protein  30.86 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2085  hypothetical protein  32.85 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.069658 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2176  hypothetical protein  33.46 
 
 		 289 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00706566  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0988  hypothetical protein  34.77 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1284  hypothetical protein  30.63 
 
 		 301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218684 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4196  transcriptional regulator  32.73 
 
 		 298 aa  135  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0122  hypothetical protein  29.56 
 
 		 312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0195  hypothetical protein  31.62 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0550  transcriptional regulator  28.72 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0679  hypothetical protein  31.25 
 
 		 287 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11701  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1239  hypothetical protein  32.27 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0282  hypothetical protein  31.52 
 
 		 283 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2987  hypothetical protein  31.25 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.387576  normal  0.124084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6051  hypothetical protein  46.15 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0159  hypothetical protein  28.16 
 
 		 283 aa  122  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.233345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3042  hypothetical protein  30.18 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2604  hypothetical protein  30.18 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2742  hypothetical protein  30.18 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2091  hypothetical protein  30.42 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6538  hypothetical protein  28.62 
 
 		 268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2196  hypothetical protein  31.43 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000497244  hitchhiker  0.00000469474 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01226  hypothetical protein  29.75 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04050  hypothetical protein  37.7 
 
 		 122 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.280957  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4605  hypothetical protein  28.29 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3596  hypothetical protein  29.74 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4284  hypothetical protein  29.77 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4812  hypothetical protein  28.57 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0419  hypothetical protein  30.38 
 
 		 294 aa  99.8  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2014  hypothetical protein  28.62 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6931  hypothetical protein  30.95 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0289  hypothetical protein  28.19 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0660  hypothetical protein  28.04 
 
 		 301 aa  89.4  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.125949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0112  hypothetical protein  28.94 
 
 		 304 aa  85.9  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2674  hypothetical protein  28.14 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00152058  normal  0.0371695 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2140  hypothetical protein  26.01 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000023466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1781  hypothetical protein  27.92 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2419  hypothetical protein  28.4 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2028  hypothetical protein  27.44 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000322678  normal  0.839611 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1442  hypothetical protein  27.38 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.37014  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3177  hypothetical protein  26.69 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4208  hypothetical protein  25 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2190  hypothetical protein  26.64 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.315226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3185  transcriptional regulator-like  26.35 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.43 
 
 		 330 aa  45.8  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000116568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.36 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  30.51 
 
 		 337 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 231 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  30.95 
 
 		 339 aa  42.7  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0172  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.1 
 
 		 242 aa  42.7  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.657073  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  28.75 
 
 		 351 aa  42.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>