66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1844 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1844  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1529  hypothetical protein  86.39 
 
 		 295 aa  527  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2085  hypothetical protein  82.56 
 
 		 302 aa  487  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.069658 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3737  hypothetical protein  77.03 
 
 		 290 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2176  hypothetical protein  64.11 
 
 		 289 aa  377  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00706566  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3103  hypothetical protein  64.86 
 
 		 282 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1356  hypothetical protein  52.52 
 
 		 298 aa  325  6e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2716  hypothetical protein  52.17 
 
 		 298 aa  323  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1284  hypothetical protein  51.81 
 
 		 301 aa  319  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218684 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1239  hypothetical protein  47.14 
 
 		 285 aa  282  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0679  hypothetical protein  49.11 
 
 		 287 aa  275  9e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11701  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0195  hypothetical protein  48.04 
 
 		 287 aa  271  8.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2987  hypothetical protein  47.57 
 
 		 294 aa  265  5e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.387576  normal  0.124084 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3042  hypothetical protein  45.77 
 
 		 300 aa  261  8.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2604  hypothetical protein  45.42 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2742  hypothetical protein  45.42 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0159  hypothetical protein  43.27 
 
 		 283 aa  245  4.9999999999999997e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.233345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0988  hypothetical protein  41.54 
 
 		 301 aa  237  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0282  hypothetical protein  38.89 
 
 		 283 aa  229  4e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4196  transcriptional regulator  41.13 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2091  hypothetical protein  40.6 
 
 		 276 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4605  hypothetical protein  37.13 
 
 		 294 aa  205  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6538  hypothetical protein  41.5 
 
 		 268 aa  205  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4284  hypothetical protein  37.87 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2063  transcriptional regulator  35.87 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.754064  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4760  transcriptional regulator  35.44 
 
 		 291 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0111  hypothetical protein  35.03 
 
 		 326 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2478  hypothetical protein  34.04 
 
 		 285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.452915  normal  0.259065 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4623  transcriptional regulator-like protein  35.09 
 
 		 291 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2844  decreased coverage  0.00000000441914 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2196  hypothetical protein  37.1 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000497244  hitchhiker  0.00000469474 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0122  hypothetical protein  33.69 
 
 		 312 aa  159  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1370  hypothetical protein  34.29 
 
 		 286 aa  159  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003231  hypothetical protein  34.06 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2094  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100358 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0550  transcriptional regulator  34.27 
 
 		 292 aa  153  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00864  predicted transcriptional regulator i A1501  31.97 
 
 		 278 aa  152  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2465  hypothetical protein  30.94 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107107  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01687  hypothetical protein  33.21 
 
 		 284 aa  148  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1262  hypothetical protein  32.14 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0913  hypothetical protein  34.78 
 
 		 279 aa  142  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01226  hypothetical protein  33.58 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3596  hypothetical protein  33.33 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3550  hypothetical protein  29.54 
 
 		 275 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.103965 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2674  hypothetical protein  33.68 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00152058  normal  0.0371695 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0660  hypothetical protein  32.16 
 
 		 301 aa  132  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.125949  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3177  hypothetical protein  31.16 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2028  hypothetical protein  31.8 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000322678  normal  0.839611 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4208  hypothetical protein  34.75 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1781  hypothetical protein  33.07 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2419  hypothetical protein  30.97 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0112  hypothetical protein  33.07 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2140  hypothetical protein  32.7 
 
 		 290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000023466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1442  hypothetical protein  30.04 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.37014  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0289  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2014  hypothetical protein  32.56 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6931  hypothetical protein  31.64 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0419  hypothetical protein  29.23 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4812  hypothetical protein  27.2 
 
 		 297 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6051  hypothetical protein  38.16 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3185  transcriptional regulator-like  30.41 
 
 		 254 aa  85.9  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04050  hypothetical protein  37.82 
 
 		 122 aa  73.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.280957  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2190  hypothetical protein  23.32 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.315226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_30  hypothetical protein  35.29 
 
 		 96 aa  48.9  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1092  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.16 
 
 		 315 aa  45.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.206539  normal  0.830453 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3646  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.57 
 
 		 309 aa  42.7  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000392325  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11950  predicted transcriptional regulator  24.29 
 
 		 699 aa  42.7  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>