65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3550 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3550  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  573  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.103965 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00864  predicted transcriptional regulator i A1501  39.93 
 
 		 278 aa  216  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4623  transcriptional regulator-like protein  39.35 
 
 		 291 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2844  decreased coverage  0.00000000441914 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4760  transcriptional regulator  39.35 
 
 		 291 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003231  hypothetical protein  39.19 
 
 		 284 aa  207  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0913  hypothetical protein  40.22 
 
 		 279 aa  207  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2063  transcriptional regulator  38.85 
 
 		 290 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.754064  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1370  hypothetical protein  39.05 
 
 		 286 aa  205  6e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1262  hypothetical protein  40.29 
 
 		 287 aa  205  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01687  hypothetical protein  37.23 
 
 		 284 aa  192  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2478  hypothetical protein  36.59 
 
 		 285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.452915  normal  0.259065 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2465  hypothetical protein  34.89 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107107  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0111  hypothetical protein  35.85 
 
 		 326 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2094  hypothetical protein  35.13 
 
 		 303 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100358 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1284  hypothetical protein  29.45 
 
 		 301 aa  141  9e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3103  hypothetical protein  31.58 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1239  hypothetical protein  31.91 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0282  hypothetical protein  31.46 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2604  hypothetical protein  32.47 
 
 		 300 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2742  hypothetical protein  32.47 
 
 		 300 aa  136  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3042  hypothetical protein  32.47 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0195  hypothetical protein  30.48 
 
 		 287 aa  135  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1844  hypothetical protein  29.54 
 
 		 295 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3737  hypothetical protein  31.16 
 
 		 290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2716  hypothetical protein  28.36 
 
 		 298 aa  132  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189563 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2176  hypothetical protein  30 
 
 		 289 aa  132  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00706566  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1356  hypothetical protein  28.57 
 
 		 298 aa  132  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2091  hypothetical protein  31.92 
 
 		 276 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1529  hypothetical protein  28.57 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4196  transcriptional regulator  31.5 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0988  hypothetical protein  31.14 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2987  hypothetical protein  30.11 
 
 		 294 aa  128  9.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.387576  normal  0.124084 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4284  hypothetical protein  33.69 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0159  hypothetical protein  28.68 
 
 		 283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.233345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0679  hypothetical protein  29 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11701  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4605  hypothetical protein  33.85 
 
 		 294 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2085  hypothetical protein  28.87 
 
 		 302 aa  119  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.069658 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0550  transcriptional regulator  26.04 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04050  hypothetical protein  40.83 
 
 		 122 aa  105  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.280957  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6538  hypothetical protein  26.75 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2196  hypothetical protein  28.28 
 
 		 296 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000497244  hitchhiker  0.00000469474 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0122  hypothetical protein  25.2 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6051  hypothetical protein  35.33 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0289  hypothetical protein  30.89 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2419  hypothetical protein  29.03 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2028  hypothetical protein  26.72 
 
 		 290 aa  93.2  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000322678  normal  0.839611 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2014  hypothetical protein  26.48 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4208  hypothetical protein  29.1 
 
 		 302 aa  89.7  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0419  hypothetical protein  26.64 
 
 		 294 aa  89.7  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3177  hypothetical protein  29.51 
 
 		 305 aa  89.7  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0660  hypothetical protein  28.51 
 
 		 301 aa  86.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.125949  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2674  hypothetical protein  27.31 
 
 		 290 aa  85.9  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00152058  normal  0.0371695 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3596  hypothetical protein  29.39 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2140  hypothetical protein  24.5 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000023466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0112  hypothetical protein  27.49 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01226  hypothetical protein  25.5 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1781  hypothetical protein  27.64 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2190  hypothetical protein  22 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.315226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6931  hypothetical protein  26.02 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1442  hypothetical protein  25.33 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.37014  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4812  hypothetical protein  24.23 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3185  transcriptional regulator-like  28.92 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  28.26 
 
 		 339 aa  50.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_30  hypothetical protein  31.25 
 
 		 96 aa  42.7  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  27.5 
 
 		 351 aa  42.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>