71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2419 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2419  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  612  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6931  hypothetical protein  56.75 
 
 		 313 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4208  hypothetical protein  55.7 
 
 		 302 aa  342  5.999999999999999e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3177  hypothetical protein  56.12 
 
 		 305 aa  340  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0660  hypothetical protein  51.42 
 
 		 301 aa  310  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.125949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0112  hypothetical protein  52.04 
 
 		 304 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1781  hypothetical protein  49.66 
 
 		 293 aa  289  3e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1442  hypothetical protein  48.76 
 
 		 304 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.37014  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2014  hypothetical protein  47.42 
 
 		 302 aa  273  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0289  hypothetical protein  48.78 
 
 		 295 aa  266  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3596  hypothetical protein  43.71 
 
 		 288 aa  247  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2674  hypothetical protein  43.66 
 
 		 290 aa  246  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00152058  normal  0.0371695 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01226  hypothetical protein  43.3 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3185  transcriptional regulator-like  51.48 
 
 		 254 aa  241  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2140  hypothetical protein  42.91 
 
 		 290 aa  240  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000023466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2028  hypothetical protein  42.81 
 
 		 290 aa  238  9e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000322678  normal  0.839611 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0419  hypothetical protein  38.78 
 
 		 294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2196  hypothetical protein  36.26 
 
 		 296 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000497244  hitchhiker  0.00000469474 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1356  hypothetical protein  34.73 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2716  hypothetical protein  34.35 
 
 		 298 aa  145  8.000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189563 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0159  hypothetical protein  34.1 
 
 		 283 aa  142  9e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.233345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3103  hypothetical protein  32.62 
 
 		 282 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1284  hypothetical protein  34.98 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218684 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2604  hypothetical protein  33.2 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3042  hypothetical protein  33.2 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2742  hypothetical protein  33.2 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0282  hypothetical protein  29.86 
 
 		 283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0988  hypothetical protein  34.94 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4196  transcriptional regulator  32.94 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4605  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  129  7.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2176  hypothetical protein  36.4 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00706566  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0122  hypothetical protein  31.11 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1844  hypothetical protein  30.97 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1529  hypothetical protein  32.25 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1239  hypothetical protein  32.42 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2190  hypothetical protein  29.29 
 
 		 297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.315226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2085  hypothetical protein  31.39 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.069658 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4284  hypothetical protein  32.18 
 
 		 289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0195  hypothetical protein  32.55 
 
 		 287 aa  115  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3737  hypothetical protein  31.25 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2091  hypothetical protein  31.73 
 
 		 276 aa  114  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2478  hypothetical protein  30.71 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.452915  normal  0.259065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2063  transcriptional regulator  30.42 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.754064  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2465  hypothetical protein  30.92 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107107  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2987  hypothetical protein  32.16 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.387576  normal  0.124084 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0550  transcriptional regulator  31.66 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1370  hypothetical protein  30.83 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003231  hypothetical protein  30.68 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0679  hypothetical protein  30.83 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11701  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4760  transcriptional regulator  29.77 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4623  transcriptional regulator-like protein  29.77 
 
 		 291 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2844  decreased coverage  0.00000000441914 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6538  hypothetical protein  30.45 
 
 		 268 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0913  hypothetical protein  28.74 
 
 		 279 aa  97.4  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00864  predicted transcriptional regulator i A1501  28.45 
 
 		 278 aa  96.7  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1262  hypothetical protein  30.17 
 
 		 287 aa  94.7  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3550  hypothetical protein  29.03 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.103965 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0111  hypothetical protein  30.68 
 
 		 326 aa  93.6  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01687  hypothetical protein  29.23 
 
 		 284 aa  90.1  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4812  hypothetical protein  29.63 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2094  hypothetical protein  28.4 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100358 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04050  hypothetical protein  35 
 
 		 122 aa  52.8  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.280957  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4323  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.32 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.807083  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0327  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.8 
 
 		 339 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1870  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.95 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2996  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.98 
 
 		 226 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5212  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25 
 
 		 317 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000701081  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0108  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  35.71 
 
 		 240 aa  46.2  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403778 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  28.83 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3107  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.25 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.786544  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.11 
 
 		 317 aa  43.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161645 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1381  transcription factor  29.03 
 
 		 363 aa  43.1  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00306961  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>