63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0913 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0913  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3550  hypothetical protein  40.22 
 
 
275 aa  207  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.103965 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00864  predicted transcriptional regulator i A1501  40.45 
 
 
278 aa  202  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2063  transcriptional regulator  38.1 
 
 
290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.754064  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4760  transcriptional regulator  35.9 
 
 
291 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4623  transcriptional regulator-like protein  35.53 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2844  decreased coverage  0.00000000441914 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2478  hypothetical protein  33.95 
 
 
285 aa  163  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.452915  normal  0.259065 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1262  hypothetical protein  36.59 
 
 
287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2094  hypothetical protein  34.17 
 
 
303 aa  158  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100358 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1370  hypothetical protein  35.77 
 
 
286 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2465  hypothetical protein  32.73 
 
 
298 aa  153  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107107  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003231  hypothetical protein  36.23 
 
 
284 aa  153  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0111  hypothetical protein  35.4 
 
 
326 aa  145  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0282  hypothetical protein  33.58 
 
 
283 aa  143  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1529  hypothetical protein  34.67 
 
 
295 aa  142  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1844  hypothetical protein  34.78 
 
 
295 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4196  transcriptional regulator  33.57 
 
 
298 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3737  hypothetical protein  33.33 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2742  hypothetical protein  32.85 
 
 
300 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2604  hypothetical protein  32.85 
 
 
300 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3042  hypothetical protein  32.85 
 
 
300 aa  139  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1284  hypothetical protein  29.93 
 
 
301 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.218684 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1356  hypothetical protein  30.88 
 
 
298 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2716  hypothetical protein  30.29 
 
 
298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189563 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01687  hypothetical protein  33.82 
 
 
284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3103  hypothetical protein  32.34 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2085  hypothetical protein  33.57 
 
 
302 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.069658 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0159  hypothetical protein  31.6 
 
 
283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.233345  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2176  hypothetical protein  31.43 
 
 
289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00706566  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0988  hypothetical protein  28.73 
 
 
301 aa  125  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2196  hypothetical protein  31.91 
 
 
296 aa  122  8e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000497244  hitchhiker  0.00000469474 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1239  hypothetical protein  31.1 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0550  transcriptional regulator  31.32 
 
 
292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6538  hypothetical protein  29.81 
 
 
268 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3177  hypothetical protein  32.3 
 
 
305 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1781  hypothetical protein  32.66 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4284  hypothetical protein  30.07 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4605  hypothetical protein  28.94 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2674  hypothetical protein  31.8 
 
 
290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00152058  normal  0.0371695 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4812  hypothetical protein  30.96 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4208  hypothetical protein  32.3 
 
 
302 aa  109  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0112  hypothetical protein  31.46 
 
 
304 aa  109  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2140  hypothetical protein  31.54 
 
 
290 aa  105  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000023466  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01226  hypothetical protein  30.25 
 
 
295 aa  105  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04050  hypothetical protein  39.17 
 
 
122 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.280957  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2091  hypothetical protein  28.04 
 
 
276 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0679  hypothetical protein  27.14 
 
 
287 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11701  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3596  hypothetical protein  32.26 
 
 
288 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0195  hypothetical protein  28.1 
 
 
287 aa  102  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342058  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2987  hypothetical protein  27.17 
 
 
294 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.387576  normal  0.124084 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0289  hypothetical protein  30.92 
 
 
295 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2028  hypothetical protein  32.16 
 
 
290 aa  99  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000322678  normal  0.839611 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2014  hypothetical protein  29.96 
 
 
302 aa  99  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2419  hypothetical protein  28.74 
 
 
299 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0419  hypothetical protein  29.26 
 
 
294 aa  97.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0660  hypothetical protein  30.74 
 
 
301 aa  97.4  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.125949  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0122  hypothetical protein  28.16 
 
 
312 aa  93.2  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6931  hypothetical protein  28.02 
 
 
313 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1442  hypothetical protein  29.58 
 
 
304 aa  86.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.37014  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3185  transcriptional regulator-like  29.38 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6051  hypothetical protein  31.97 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2190  hypothetical protein  23.41 
 
 
297 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.315226  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  34.78 
 
 
351 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>