75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6931 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6931  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  644    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2419  hypothetical protein  56.75 
 
 		 299 aa  343  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3177  hypothetical protein  54.67 
 
 		 305 aa  333  2e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4208  hypothetical protein  52.9 
 
 		 302 aa  325  9e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1781  hypothetical protein  51.23 
 
 		 293 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0660  hypothetical protein  51.24 
 
 		 301 aa  310  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.125949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0112  hypothetical protein  49.83 
 
 		 304 aa  296  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2014  hypothetical protein  48.61 
 
 		 302 aa  293  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1442  hypothetical protein  47.7 
 
 		 304 aa  291  8e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.37014  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0289  hypothetical protein  47.22 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3185  transcriptional regulator-like  50 
 
 		 254 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01226  hypothetical protein  44.33 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3596  hypothetical protein  43.15 
 
 		 288 aa  241  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2674  hypothetical protein  40.28 
 
 		 290 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00152058  normal  0.0371695 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2140  hypothetical protein  40.42 
 
 		 290 aa  235  6e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000023466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2028  hypothetical protein  42.46 
 
 		 290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000322678  normal  0.839611 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0419  hypothetical protein  36.26 
 
 		 294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2196  hypothetical protein  35.21 
 
 		 296 aa  151  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000497244  hitchhiker  0.00000469474 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0282  hypothetical protein  31.76 
 
 		 283 aa  136  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2190  hypothetical protein  33.81 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.315226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0988  hypothetical protein  33.21 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3042  hypothetical protein  31.71 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2742  hypothetical protein  31.3 
 
 		 300 aa  126  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2604  hypothetical protein  31.3 
 
 		 300 aa  126  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4196  transcriptional regulator  30.07 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1239  hypothetical protein  34.07 
 
 		 285 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0159  hypothetical protein  30.5 
 
 		 283 aa  119  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.233345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6538  hypothetical protein  33.76 
 
 		 268 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1844  hypothetical protein  31.64 
 
 		 295 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1284  hypothetical protein  30.27 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218684 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1356  hypothetical protein  30.35 
 
 		 298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2176  hypothetical protein  31.1 
 
 		 289 aa  115  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00706566  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4605  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2716  hypothetical protein  29.96 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189563 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4284  hypothetical protein  33.46 
 
 		 289 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1370  hypothetical protein  32.97 
 
 		 286 aa  113  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3737  hypothetical protein  31.89 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1529  hypothetical protein  30 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0122  hypothetical protein  30.34 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0195  hypothetical protein  32.27 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3103  hypothetical protein  29.48 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2478  hypothetical protein  28.22 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.452915  normal  0.259065 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2091  hypothetical protein  28.4 
 
 		 276 aa  102  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1262  hypothetical protein  32.14 
 
 		 287 aa  102  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0679  hypothetical protein  30.12 
 
 		 287 aa  102  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11701  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003231  hypothetical protein  31.54 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2085  hypothetical protein  29.13 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.069658 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01687  hypothetical protein  32.69 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0550  transcriptional regulator  31.18 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2987  hypothetical protein  29.84 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.387576  normal  0.124084 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2094  hypothetical protein  30.95 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2063  transcriptional regulator  30.86 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.754064  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0111  hypothetical protein  28.35 
 
 		 326 aa  93.2  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2465  hypothetical protein  30.53 
 
 		 298 aa  90.9  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107107  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0913  hypothetical protein  28.02 
 
 		 279 aa  90.1  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4760  transcriptional regulator  30.74 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4623  transcriptional regulator-like protein  30.35 
 
 		 291 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2844  decreased coverage  0.00000000441914 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00864  predicted transcriptional regulator i A1501  26.12 
 
 		 278 aa  86.7  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3550  hypothetical protein  26.02 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.103965 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4812  hypothetical protein  26.36 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5238  transcriptional regulator  26.21 
 
 		 304 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0694  Helix-turn-helix type 11 domain protein  36.23 
 
 		 246 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4005  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 246 aa  49.7  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04050  hypothetical protein  32 
 
 		 122 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.280957  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3107  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.21 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.786544  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  40.91 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2996  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  36.62 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4323  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  35.82 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.807083  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11950  predicted transcriptional regulator  37.7 
 
 		 699 aa  43.5  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0977  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 360 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.06 
 
 		 326 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8630  DeoR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 322 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  28.86 
 
 		 663 aa  42.7  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3039  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.21 
 
 		 235 aa  42.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.53 
 
 		 317 aa  42.4  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>