65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0289 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0289  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  601  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2014  hypothetical protein  51.59 
 
 
302 aa  292  5e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0660  hypothetical protein  48.95 
 
 
301 aa  290  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.125949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0112  hypothetical protein  47.77 
 
 
304 aa  267  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2419  hypothetical protein  48.78 
 
 
299 aa  266  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4208  hypothetical protein  47.59 
 
 
302 aa  265  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3177  hypothetical protein  46.5 
 
 
305 aa  258  8e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6931  hypothetical protein  47.22 
 
 
313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1781  hypothetical protein  44.68 
 
 
293 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01226  hypothetical protein  42.62 
 
 
295 aa  236  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2674  hypothetical protein  41.28 
 
 
290 aa  233  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00152058  normal  0.0371695 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2028  hypothetical protein  42.66 
 
 
290 aa  229  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000322678  normal  0.839611 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1442  hypothetical protein  42.31 
 
 
304 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.37014  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3596  hypothetical protein  39.65 
 
 
288 aa  224  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2140  hypothetical protein  40.57 
 
 
290 aa  224  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000023466  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0419  hypothetical protein  40.97 
 
 
294 aa  208  8e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3185  transcriptional regulator-like  45.15 
 
 
254 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2196  hypothetical protein  39.29 
 
 
296 aa  162  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000497244  hitchhiker  0.00000469474 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0988  hypothetical protein  33.33 
 
 
301 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2063  transcriptional regulator  33.47 
 
 
290 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.754064  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2190  hypothetical protein  29.68 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.315226  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2478  hypothetical protein  31.85 
 
 
285 aa  127  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.452915  normal  0.259065 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0282  hypothetical protein  33.6 
 
 
283 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4760  transcriptional regulator  33.86 
 
 
291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4623  transcriptional regulator-like protein  33.47 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2844  decreased coverage  0.00000000441914 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3103  hypothetical protein  31.68 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4196  transcriptional regulator  31.65 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1844  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1284  hypothetical protein  32.42 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.218684 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1529  hypothetical protein  31.8 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2716  hypothetical protein  30.95 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1356  hypothetical protein  30.95 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2604  hypothetical protein  31.18 
 
 
300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3042  hypothetical protein  31.18 
 
 
300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2742  hypothetical protein  31.18 
 
 
300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0159  hypothetical protein  30.59 
 
 
283 aa  112  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.233345  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2176  hypothetical protein  33.33 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00706566  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003231  hypothetical protein  32.06 
 
 
284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0111  hypothetical protein  31 
 
 
326 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3737  hypothetical protein  31.43 
 
 
290 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1370  hypothetical protein  29.09 
 
 
286 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2085  hypothetical protein  30.04 
 
 
302 aa  106  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.069658 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2091  hypothetical protein  30.24 
 
 
276 aa  106  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1239  hypothetical protein  31.16 
 
 
285 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2465  hypothetical protein  32.06 
 
 
298 aa  105  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107107  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0122  hypothetical protein  28.63 
 
 
312 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2987  hypothetical protein  29.52 
 
 
294 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.387576  normal  0.124084 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1262  hypothetical protein  29.92 
 
 
287 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00864  predicted transcriptional regulator i A1501  33.05 
 
 
278 aa  103  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01687  hypothetical protein  30.6 
 
 
284 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4605  hypothetical protein  30.74 
 
 
294 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0913  hypothetical protein  30.92 
 
 
279 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4284  hypothetical protein  30.3 
 
 
289 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3550  hypothetical protein  30.89 
 
 
275 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.103965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0195  hypothetical protein  28.67 
 
 
287 aa  99.4  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342058  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0550  transcriptional regulator  30.74 
 
 
292 aa  99  8e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0679  hypothetical protein  27.31 
 
 
287 aa  95.9  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11701  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2094  hypothetical protein  28.19 
 
 
303 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100358 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6538  hypothetical protein  29.13 
 
 
268 aa  89  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6051  hypothetical protein  30.61 
 
 
280 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04050  hypothetical protein  33.33 
 
 
122 aa  53.5  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.280957  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4812  hypothetical protein  28.33 
 
 
297 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4323  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.77 
 
 
327 aa  49.3  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.807083  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0249  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.25 
 
 
324 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3846  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.92 
 
 
230 aa  43.1  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80209  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>