90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3185 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3185  transcriptional regulator-like  100 
 
 		 254 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3177  hypothetical protein  61.6 
 
 		 305 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4208  hypothetical protein  61.92 
 
 		 302 aa  316  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0112  hypothetical protein  53.94 
 
 		 304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0660  hypothetical protein  51.05 
 
 		 301 aa  255  5e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.125949  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6931  hypothetical protein  50 
 
 		 313 aa  251  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2419  hypothetical protein  51.48 
 
 		 299 aa  241  7e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1781  hypothetical protein  49.58 
 
 		 293 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2014  hypothetical protein  41.6 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1442  hypothetical protein  41.35 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.37014  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0289  hypothetical protein  45.15 
 
 		 295 aa  192  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01226  hypothetical protein  38.43 
 
 		 295 aa  185  7e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3596  hypothetical protein  39.08 
 
 		 288 aa  181  7e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2140  hypothetical protein  36.97 
 
 		 290 aa  169  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000023466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2674  hypothetical protein  38.33 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00152058  normal  0.0371695 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2028  hypothetical protein  36.86 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000322678  normal  0.839611 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0419  hypothetical protein  37.22 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2196  hypothetical protein  38.63 
 
 		 296 aa  118  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000497244  hitchhiker  0.00000469474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2742  hypothetical protein  32.85 
 
 		 300 aa  99.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2604  hypothetical protein  32.85 
 
 		 300 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3042  hypothetical protein  32.85 
 
 		 300 aa  99.4  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4605  hypothetical protein  33.77 
 
 		 294 aa  95.9  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0988  hypothetical protein  32 
 
 		 301 aa  94  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2190  hypothetical protein  32.56 
 
 		 297 aa  92  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.315226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3737  hypothetical protein  33.8 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4760  transcriptional regulator  33.95 
 
 		 291 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4196  transcriptional regulator  31.07 
 
 		 298 aa  89.4  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0282  hypothetical protein  29.58 
 
 		 283 aa  88.2  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4284  hypothetical protein  30.8 
 
 		 289 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2176  hypothetical protein  32.72 
 
 		 289 aa  87  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00706566  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1844  hypothetical protein  30.41 
 
 		 295 aa  85.9  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2063  transcriptional regulator  30.09 
 
 		 290 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.754064  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0159  hypothetical protein  28.5 
 
 		 283 aa  86.3  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.233345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4623  transcriptional regulator-like protein  33.49 
 
 		 291 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2844  decreased coverage  0.00000000441914 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1370  hypothetical protein  29.41 
 
 		 286 aa  85.5  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2478  hypothetical protein  28.51 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.452915  normal  0.259065 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1284  hypothetical protein  30.63 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218684 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2085  hypothetical protein  29.26 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.069658 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2465  hypothetical protein  30.91 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107107  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1356  hypothetical protein  29.39 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1529  hypothetical protein  29.49 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003231  hypothetical protein  29.15 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3103  hypothetical protein  31.48 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2716  hypothetical protein  28.95 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1239  hypothetical protein  30.23 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0111  hypothetical protein  31.42 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0913  hypothetical protein  29.38 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2091  hypothetical protein  27.47 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1262  hypothetical protein  27.88 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0679  hypothetical protein  28.57 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11701  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0195  hypothetical protein  29.19 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01687  hypothetical protein  30.2 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00864  predicted transcriptional regulator i A1501  29.8 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6538  hypothetical protein  29.17 
 
 		 268 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3550  hypothetical protein  28.92 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.103965 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2987  hypothetical protein  28.71 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.387576  normal  0.124084 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0550  transcriptional regulator  26.48 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0122  hypothetical protein  27.65 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4812  hypothetical protein  26.15 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2094  hypothetical protein  26.35 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5106  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.63 
 
 		 319 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal  0.201643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0977  DeoR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 360 aa  48.5  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0694  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.37 
 
 		 246 aa  48.5  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4059  helix-turn-helix, type 11  38.81 
 
 		 318 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348793  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0284  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.28 
 
 		 332 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2687  transcriptional regulator-like protein  34.52 
 
 		 331 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0327  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.57 
 
 		 339 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  27.84 
 
 		 339 aa  46.6  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0581  transcriptional regulator-like  32.5 
 
 		 367 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4323  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  36.62 
 
 		 327 aa  45.8  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.807083  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2057  transcriptional regulator-like protein  43.86 
 
 		 320 aa  46.2  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090135  normal  0.188447 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0960  helix-turn-helix, type 11  29.63 
 
 		 317 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0978  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.63 
 
 		 317 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318116  normal  0.0703128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0988  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.63 
 
 		 317 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1870  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  34.57 
 
 		 337 aa  45.4  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5212  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.58 
 
 		 317 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000701081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0616  transcriptional regulator-like protein  31.25 
 
 		 369 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0608  transcriptional regulator-like protein  30.49 
 
 		 364 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.588838  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  29.79 
 
 		 336 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3412  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.88 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  31.82 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4738  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  32.14 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.947562  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04050  hypothetical protein  31 
 
 		 122 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.280957  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1363  YobV  30.56 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.396054  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0335  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.77 
 
 		 321 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.377994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3107  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.92 
 
 		 324 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.786544  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  32.29 
 
 		 687 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.48 
 
 		 335 aa  43.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2361  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  35 
 
 		 164 aa  42.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.0484328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4133  DeoR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 317 aa  42  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113991  normal  0.040793 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>