65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2742 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2604  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  621  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2742  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  621  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3042  hypothetical protein  99.33 
 
 		 300 aa  617  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0988  hypothetical protein  58.57 
 
 		 301 aa  354  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4605  hypothetical protein  54.45 
 
 		 294 aa  324  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4284  hypothetical protein  56.16 
 
 		 289 aa  323  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4196  transcriptional regulator  45.36 
 
 		 298 aa  261  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1844  hypothetical protein  45.42 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3737  hypothetical protein  46.55 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1529  hypothetical protein  44.52 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1356  hypothetical protein  44.2 
 
 		 298 aa  251  9.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2716  hypothetical protein  43.68 
 
 		 298 aa  250  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1284  hypothetical protein  43.32 
 
 		 301 aa  248  9e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3103  hypothetical protein  42.7 
 
 		 282 aa  246  4e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2176  hypothetical protein  43.91 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00706566  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2085  hypothetical protein  42.91 
 
 		 302 aa  235  9e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.069658 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1239  hypothetical protein  38.41 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0679  hypothetical protein  41.16 
 
 		 287 aa  219  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11701  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2091  hypothetical protein  41.6 
 
 		 276 aa  215  7e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0195  hypothetical protein  39.71 
 
 		 287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2987  hypothetical protein  40.79 
 
 		 294 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.387576  normal  0.124084 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0282  hypothetical protein  36.96 
 
 		 283 aa  210  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0159  hypothetical protein  36.24 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.233345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2063  transcriptional regulator  34.64 
 
 		 290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.754064  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6538  hypothetical protein  37.25 
 
 		 268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4760  transcriptional regulator  33.93 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4623  transcriptional regulator-like protein  33.93 
 
 		 291 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2844  decreased coverage  0.00000000441914 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0550  transcriptional regulator  34.97 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0111  hypothetical protein  33.94 
 
 		 326 aa  155  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2478  hypothetical protein  31.9 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.452915  normal  0.259065 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2196  hypothetical protein  33.21 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000497244  hitchhiker  0.00000469474 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1262  hypothetical protein  32.75 
 
 		 287 aa  150  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003231  hypothetical protein  32.74 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1370  hypothetical protein  32.03 
 
 		 286 aa  145  9e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2465  hypothetical protein  31.82 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107107  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0660  hypothetical protein  34.74 
 
 		 301 aa  142  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.125949  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0913  hypothetical protein  32.85 
 
 		 279 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01687  hypothetical protein  31.32 
 
 		 284 aa  139  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2419  hypothetical protein  33.2 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2028  hypothetical protein  35.38 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000322678  normal  0.839611 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3550  hypothetical protein  32.47 
 
 		 275 aa  136  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.103965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4208  hypothetical protein  35.77 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3177  hypothetical protein  34.96 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3596  hypothetical protein  32.28 
 
 		 288 aa  133  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1442  hypothetical protein  33.1 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.37014  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2140  hypothetical protein  32.95 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000023466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2674  hypothetical protein  31.36 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00152058  normal  0.0371695 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01226  hypothetical protein  33.93 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6931  hypothetical protein  31.3 
 
 		 313 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0112  hypothetical protein  35.63 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0122  hypothetical protein  28.62 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2014  hypothetical protein  30.42 
 
 		 302 aa  123  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00864  predicted transcriptional regulator i A1501  30.15 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2094  hypothetical protein  30.18 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100358 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1781  hypothetical protein  33.33 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0289  hypothetical protein  31.18 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0419  hypothetical protein  27.43 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3185  transcriptional regulator-like  32.85 
 
 		 254 aa  99.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4812  hypothetical protein  27.8 
 
 		 297 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04050  hypothetical protein  32.5 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.280957  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2190  hypothetical protein  25.54 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.315226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6051  hypothetical protein  30.67 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  34.92 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.47 
 
 		 315 aa  43.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0108  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  32.58 
 
 		 240 aa  42.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>