65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4208 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4208  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  622  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3177  hypothetical protein  85.52 
 
 		 305 aa  528  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0112  hypothetical protein  75.17 
 
 		 304 aa  462  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2419  hypothetical protein  55.7 
 
 		 299 aa  342  5.999999999999999e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0660  hypothetical protein  52.58 
 
 		 301 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.125949  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6931  hypothetical protein  52.9 
 
 		 313 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3185  transcriptional regulator-like  61.92 
 
 		 254 aa  316  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1781  hypothetical protein  52.76 
 
 		 293 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2014  hypothetical protein  45.97 
 
 		 302 aa  288  7e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1442  hypothetical protein  44.95 
 
 		 304 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.37014  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0289  hypothetical protein  47.59 
 
 		 295 aa  265  8e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01226  hypothetical protein  44.86 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3596  hypothetical protein  43.21 
 
 		 288 aa  248  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2028  hypothetical protein  44.41 
 
 		 290 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000322678  normal  0.839611 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2140  hypothetical protein  41.75 
 
 		 290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000023466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2674  hypothetical protein  40.7 
 
 		 290 aa  227  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00152058  normal  0.0371695 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0419  hypothetical protein  37.36 
 
 		 294 aa  182  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2196  hypothetical protein  35.58 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000497244  hitchhiker  0.00000469474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2742  hypothetical protein  35.77 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2604  hypothetical protein  35.77 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3737  hypothetical protein  35.14 
 
 		 290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3042  hypothetical protein  35.37 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1529  hypothetical protein  35.91 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3103  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1844  hypothetical protein  34.75 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2176  hypothetical protein  35.27 
 
 		 289 aa  125  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00706566  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1284  hypothetical protein  34.11 
 
 		 301 aa  125  9e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218684 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4196  transcriptional regulator  32.38 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1356  hypothetical protein  32.3 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0282  hypothetical protein  32.03 
 
 		 283 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2190  hypothetical protein  30.1 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.315226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2716  hypothetical protein  31.91 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189563 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0159  hypothetical protein  31.85 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.233345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0988  hypothetical protein  31.8 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0195  hypothetical protein  32.02 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2085  hypothetical protein  32.56 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.069658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0679  hypothetical protein  31.85 
 
 		 287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11701  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2987  hypothetical protein  31.45 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.387576  normal  0.124084 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2091  hypothetical protein  30.68 
 
 		 276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0913  hypothetical protein  32.3 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1239  hypothetical protein  30.31 
 
 		 285 aa  109  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2063  transcriptional regulator  32.17 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.754064  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2478  hypothetical protein  28.62 
 
 		 285 aa  105  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.452915  normal  0.259065 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0122  hypothetical protein  30.22 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6538  hypothetical protein  30.43 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4605  hypothetical protein  30 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0550  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0111  hypothetical protein  29.41 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4284  hypothetical protein  29.23 
 
 		 289 aa  99.8  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4760  transcriptional regulator  32.17 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4623  transcriptional regulator-like protein  32.17 
 
 		 291 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2844  decreased coverage  0.00000000441914 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003231  hypothetical protein  28.57 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3550  hypothetical protein  29.1 
 
 		 275 aa  89.7  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.103965 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1370  hypothetical protein  27.92 
 
 		 286 aa  89  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1262  hypothetical protein  28.68 
 
 		 287 aa  89  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00864  predicted transcriptional regulator i A1501  27.13 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01687  hypothetical protein  27.53 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2465  hypothetical protein  26.32 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107107  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2094  hypothetical protein  25 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100358 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4812  hypothetical protein  26.45 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0327  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.43 
 
 		 339 aa  45.8  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4323  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.43 
 
 		 327 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.807083  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04050  hypothetical protein  31.07 
 
 		 122 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.280957  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6051  hypothetical protein  27.03 
 
 		 280 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3107  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.4 
 
 		 324 aa  42.7  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.786544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>