29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_p840_30 on replicon NC_011311
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011311  VSAL_p840_30  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  200  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3737  hypothetical protein  43.75 
 
 		 290 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1529  hypothetical protein  36.76 
 
 		 295 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2478  hypothetical protein  41.54 
 
 		 285 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.452915  normal  0.259065 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1356  hypothetical protein  33.77 
 
 		 298 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2716  hypothetical protein  33.77 
 
 		 298 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1284  hypothetical protein  32.35 
 
 		 301 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218684 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2085  hypothetical protein  37.31 
 
 		 302 aa  50.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.069658 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1844  hypothetical protein  35.29 
 
 		 295 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2176  hypothetical protein  36.51 
 
 		 289 aa  47.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00706566  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0122  hypothetical protein  33.78 
 
 		 312 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0988  hypothetical protein  36.23 
 
 		 301 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1370  hypothetical protein  36.36 
 
 		 286 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2465  hypothetical protein  35.38 
 
 		 298 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107107  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2987  hypothetical protein  31.17 
 
 		 294 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.387576  normal  0.124084 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0195  hypothetical protein  32.43 
 
 		 287 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4196  transcriptional regulator  35.09 
 
 		 298 aa  43.5  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0111  hypothetical protein  40.38 
 
 		 326 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2063  transcriptional regulator  32 
 
 		 290 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.754064  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0550  transcriptional regulator  31.51 
 
 		 292 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0660  hypothetical protein  27.71 
 
 		 301 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.125949  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3550  hypothetical protein  31.25 
 
 		 275 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.103965 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2674  hypothetical protein  31.33 
 
 		 290 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00152058  normal  0.0371695 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0282  hypothetical protein  30 
 
 		 283 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01687  hypothetical protein  32.26 
 
 		 284 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0159  hypothetical protein  26.09 
 
 		 283 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.233345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003231  hypothetical protein  34.85 
 
 		 284 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6051  hypothetical protein  30.77 
 
 		 280 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0679  hypothetical protein  32.47 
 
 		 287 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11701  normal  0.340076 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>