76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2965 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  530  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  49.43 
 
 		 379 aa  222  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  43.89 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  40.96 
 
 		 276 aa  185  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  41.6 
 
 		 280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  43.31 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  40.78 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  42.13 
 
 		 271 aa  160  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  36.47 
 
 		 272 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  42.96 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  38.29 
 
 		 278 aa  142  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  40.47 
 
 		 272 aa  139  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  35.07 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  38.8 
 
 		 294 aa  132  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  37.23 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  37.87 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  35.83 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  35.05 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  37.24 
 
 		 239 aa  123  4e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  42.06 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  42.05 
 
 		 301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  34.11 
 
 		 249 aa  118  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  34.3 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  40.89 
 
 		 285 aa  108  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  36.13 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  38.72 
 
 		 254 aa  99  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  34.93 
 
 		 750 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  37.64 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  35.41 
 
 		 246 aa  95.5  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6354  putative ABC transporter integral membrane subunit  33.6 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2017  integral membrane protein  36.67 
 
 		 310 aa  92.4  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257608  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  29.1 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  33.57 
 
 		 278 aa  89.7  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4129  hypothetical protein  34.48 
 
 		 280 aa  89.4  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2235  hypothetical protein  35.5 
 
 		 255 aa  89  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  32.84 
 
 		 243 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6408  hypothetical protein  39.53 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  31.9 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  38.12 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  31.94 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  24.64 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  35.1 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  35.1 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  35.1 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  38.55 
 
 		 259 aa  72  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  30.53 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1899  hypothetical protein  33.14 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2131  ABC transporter integral membrane protein  34.24 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5874  hypothetical protein  36.59 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.138956 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0312  hypothetical protein  32.06 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.228119 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0713  putative ABC transporter membrane protein  33.79 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00955733  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  28.9 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  30.22 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  31.47 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1435  putative integral membrane protein  32.58 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.973684  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2844  integral membrane protein  31.6 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0459878 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2000  putative ABC transporter transmembrane protein  37.74 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0101  hypothetical protein  23.67 
 
 		 324 aa  55.5  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.250348 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03510  hypothetical protein  30.53 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  31.28 
 
 		 504 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5648  hypothetical protein  33.64 
 
 		 518 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  28.11 
 
 		 246 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5875  hypothetical protein  50 
 
 		 543 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.191888 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3741  ABC transporter permease  30.94 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3689  hypothetical protein  27.04 
 
 		 274 aa  48.9  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03520  hypothetical protein  32.9 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.972538 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7019  hypothetical protein  30 
 
 		 257 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  31.52 
 
 		 253 aa  47  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  25.1 
 
 		 248 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1978  integral membrane protein  37.72 
 
 		 289 aa  46.2  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6185  hypothetical protein  33.57 
 
 		 264 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1805  hypothetical protein  31.08 
 
 		 269 aa  45.8  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0192  putative ABC transporter membrane protein  37.31 
 
 		 252 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4256  ABC transporter integral membrane protein  25.58 
 
 		 301 aa  45.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0893  hypothetical protein  30.59 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06370  hypothetical protein  30.46 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>