45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06370 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_06370  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  494  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5480  hypothetical protein  47.73 
 
 		 264 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  decreased coverage  0.00330894 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  34.84 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0893  hypothetical protein  32.5 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  40.14 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  31.84 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30560  hypothetical protein  35.08 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  30.88 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  30.88 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  30.88 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09550  hypothetical protein  31.34 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  29.7 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1805  hypothetical protein  29.02 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  31.3 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  30.55 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0713  putative ABC transporter membrane protein  33.94 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00955733  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  29.95 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  31.19 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  32.14 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4069  hypothetical protein  33.01 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282629  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3741  ABC transporter permease  29.41 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6251  hypothetical protein  29.49 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  29.85 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18440  hypothetical protein  29.57 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.59801  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  31.88 
 
 		 283 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  29.15 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  30.49 
 
 		 249 aa  53.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  31.43 
 
 		 272 aa  52.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  29.13 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  26.77 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7019  hypothetical protein  32.34 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4498  hypothetical protein  35.65 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.952254  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  25 
 
 		 296 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  25.33 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  28.57 
 
 		 276 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  29.55 
 
 		 277 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  26.87 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6185  hypothetical protein  30.29 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  29.08 
 
 		 271 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3689  hypothetical protein  41.51 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4408  hypothetical protein  31.58 
 
 		 263 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  33.87 
 
 		 254 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  27.85 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7277  hypothetical protein  44.19 
 
 		 260 aa  42.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40802  normal  0.0842376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  30.96 
 
 		 276 aa  42  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>