20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6251 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6251  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  558  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30560  hypothetical protein  43.81 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5480  hypothetical protein  29.28 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  decreased coverage  0.00330894 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0893  hypothetical protein  29.46 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09550  hypothetical protein  26.85 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  28.57 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1805  hypothetical protein  29.52 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06370  hypothetical protein  32.03 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  38.71 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18440  hypothetical protein  28.21 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.59801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  28.45 
 
 		 260 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  24.67 
 
 		 248 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  30.77 
 
 		 255 aa  52.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  30.08 
 
 		 253 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  30 
 
 		 246 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  30 
 
 		 246 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  30 
 
 		 246 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4069  hypothetical protein  27.44 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282629  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  23.44 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  30.08 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>