34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4069 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4069  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  524  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282629  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3689  hypothetical protein  46.76 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  32.97 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1805  hypothetical protein  31.7 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09550  hypothetical protein  32.3 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  27.37 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0893  hypothetical protein  32.07 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  31.61 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5480  hypothetical protein  29.23 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  decreased coverage  0.00330894 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06370  hypothetical protein  37.96 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18440  hypothetical protein  28.62 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.59801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2733  hypothetical protein  29.47 
 
 		 266 aa  53.5  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.210858  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  25.72 
 
 		 308 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  30 
 
 		 239 aa  52.4  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  25.81 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  26.74 
 
 		 248 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0097  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  49.7  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6251  hypothetical protein  29.09 
 
 		 291 aa  49.3  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  22.91 
 
 		 280 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  27.37 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  29.69 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  29.69 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  29.69 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  25.18 
 
 		 276 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  30.16 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0713  putative ABC transporter membrane protein  31.72 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00955733  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  23.74 
 
 		 296 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3067  membrane spanning protein  24.23 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.688803  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1322  hypothetical protein  31.85 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  25.24 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  26.27 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  27.51 
 
 		 255 aa  42.7  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  28.11 
 
 		 253 aa  42  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4498  hypothetical protein  26.94 
 
 		 272 aa  42  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.952254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>