54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1708 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  468  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  33.87 
 
 
246 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  41.43 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1805  hypothetical protein  34.65 
 
 
269 aa  89  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126976  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  34.36 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  29.69 
 
 
280 aa  82  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5480  hypothetical protein  30.68 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  decreased coverage  0.00330894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  33.84 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  31.87 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09550  hypothetical protein  28.47 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  29.37 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  30.7 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06370  hypothetical protein  35.16 
 
 
265 aa  64.7  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0893  hypothetical protein  31.6 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  30.15 
 
 
271 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4069  hypothetical protein  28.41 
 
 
271 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282629  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  29.33 
 
 
246 aa  62.8  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6251  hypothetical protein  28.51 
 
 
291 aa  62.4  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  29.41 
 
 
276 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  26.92 
 
 
279 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1682  hypothetical protein  33.2 
 
 
277 aa  59.7  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  28.74 
 
 
276 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  31.16 
 
 
265 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3741  ABC transporter permease  27.59 
 
 
256 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  33.33 
 
 
256 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3689  hypothetical protein  32.14 
 
 
274 aa  56.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  27.32 
 
 
239 aa  56.6  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  33.83 
 
 
246 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  33.83 
 
 
246 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  28.36 
 
 
308 aa  56.2  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  33.83 
 
 
246 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  28.95 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1282  ABC transporter, permease protein, putative  27.72 
 
 
258 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137706  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  30.05 
 
 
272 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  25.9 
 
 
251 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  29.59 
 
 
278 aa  52.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  29.13 
 
 
276 aa  52.4  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3889  hypothetical protein  32.34 
 
 
294 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.972905 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30560  hypothetical protein  25.34 
 
 
297 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  29.59 
 
 
283 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  25.79 
 
 
294 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18440  hypothetical protein  27.34 
 
 
265 aa  49.7  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.59801  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4498  hypothetical protein  27.81 
 
 
272 aa  50.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.952254  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  28.11 
 
 
272 aa  49.3  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  26.72 
 
 
256 aa  49.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6514  putative ABC transporter integral membrane protein  29.74 
 
 
272 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.711681  normal  0.0495934 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  23 
 
 
297 aa  47  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  31.93 
 
 
287 aa  47  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2235  hypothetical protein  29.73 
 
 
255 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  28.16 
 
 
292 aa  45.8  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  26.78 
 
 
277 aa  45.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  25 
 
 
298 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6354  putative ABC transporter integral membrane subunit  27.49 
 
 
250 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0419  hypothetical protein  32.06 
 
 
284 aa  42.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>