33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09550 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_09550  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  508  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1805  hypothetical protein  47.62 
 
 		 269 aa  208  8e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0893  hypothetical protein  46.69 
 
 		 266 aa  202  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  38.92 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  32.36 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4069  hypothetical protein  29.68 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282629  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6251  hypothetical protein  27.76 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  35.65 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5480  hypothetical protein  30.24 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  decreased coverage  0.00330894 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3689  hypothetical protein  30.04 
 
 		 274 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18440  hypothetical protein  31 
 
 		 265 aa  72  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.59801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  31.5 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06370  hypothetical protein  30.31 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  31.5 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  30.34 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  29.45 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30560  hypothetical protein  27.4 
 
 		 297 aa  57  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  31.75 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  26.7 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  35.4 
 
 		 246 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  35.4 
 
 		 246 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  35.4 
 
 		 246 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  27.92 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  30.77 
 
 		 243 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0713  putative ABC transporter membrane protein  33.14 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00955733  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  32.41 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  33.91 
 
 		 285 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  29.6 
 
 		 283 aa  46.2  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  30.96 
 
 		 249 aa  45.8  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  36.52 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0312  hypothetical protein  31.78 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.228119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  25.41 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  30.6 
 
 		 276 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>