52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6354 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6354  putative ABC transporter integral membrane subunit  100 
 
 		 250 aa  488  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  35.04 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  33.87 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  34.41 
 
 		 379 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  37.3 
 
 		 271 aa  115  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  27.6 
 
 		 272 aa  94  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  30.4 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  34.73 
 
 		 276 aa  91.3  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  33.6 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  29.92 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  31.03 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  31.11 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4129  hypothetical protein  29.68 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  30.71 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  28.96 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  27.94 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  32.22 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  30.56 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  30.22 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  29.34 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  32.39 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  29.34 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  31.73 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  30.31 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  31.13 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  28.91 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  27.31 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0713  putative ABC transporter membrane protein  32.42 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00955733  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1899  hypothetical protein  29.01 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  28.43 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  29.95 
 
 		 750 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  38.24 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  28.49 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  29.1 
 
 		 246 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  29.1 
 
 		 246 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6408  hypothetical protein  30.84 
 
 		 287 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  29.1 
 
 		 246 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  26.4 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3490  hypothetical protein  28.57 
 
 		 274 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  25.87 
 
 		 308 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  28.89 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0312  hypothetical protein  32.77 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.228119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  27.83 
 
 		 265 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  26.2 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5874  hypothetical protein  36.67 
 
 		 265 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.138956 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06370  hypothetical protein  26.15 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  27.32 
 
 		 249 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  26.21 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  29.46 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  26.72 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  23.94 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  25 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>