52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5647 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1899  hypothetical protein  50 
 
 		 251 aa  165  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5874  hypothetical protein  51.72 
 
 		 265 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.138956 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  33.99 
 
 		 272 aa  108  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4807  hypothetical protein  50.66 
 
 		 450 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.280649  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 379 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  33.72 
 
 		 280 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  34.88 
 
 		 278 aa  99  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  30.31 
 
 		 271 aa  96.7  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  33.46 
 
 		 294 aa  94.7  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  37.84 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  31.75 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  29.5 
 
 		 279 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  32.86 
 
 		 239 aa  90.5  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  30.71 
 
 		 276 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  28.91 
 
 		 276 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  35.63 
 
 		 276 aa  87  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  36.5 
 
 		 256 aa  85.5  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  38.51 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  31.09 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  31.15 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  31.12 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6354  putative ABC transporter integral membrane subunit  29.69 
 
 		 250 aa  72  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  29.19 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  31.94 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  29.64 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  33.07 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  35.36 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  35.36 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  35.36 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  30.67 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  35.96 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  29.08 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  29.19 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  35.03 
 
 		 301 aa  62  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  27.37 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  28.44 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  26.24 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  32.39 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6408  hypothetical protein  31.44 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2235  hypothetical protein  32.96 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  31.39 
 
 		 504 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0312  hypothetical protein  31.15 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.228119 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  31.22 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  30.2 
 
 		 246 aa  49.3  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  26.77 
 
 		 259 aa  48.9  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5648  hypothetical protein  32.12 
 
 		 518 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  34.56 
 
 		 750 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5875  hypothetical protein  34.98 
 
 		 543 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.191888 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4129  hypothetical protein  28.5 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  31.61 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06370  hypothetical protein  34.33 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>