74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1539 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  100 
 
 		 280 aa  551  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  44.06 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  39.77 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  39.41 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  40.93 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  38.03 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  39.62 
 
 		 276 aa  149  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  42.91 
 
 		 271 aa  142  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  36.05 
 
 		 276 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  37.45 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  34.67 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  34.44 
 
 		 283 aa  122  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  29.24 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  29.25 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  36.6 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  33.7 
 
 		 278 aa  105  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  34.18 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  35.03 
 
 		 249 aa  96.3  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  34.1 
 
 		 271 aa  96.3  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  34.91 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  32.34 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  28.14 
 
 		 253 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  31.21 
 
 		 292 aa  85.5  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  37.5 
 
 		 301 aa  85.5  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  28.85 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  29.27 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2017  integral membrane protein  34.94 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257608  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  35.96 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  30 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  25.85 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  27.24 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  27.96 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  33.72 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  28.19 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  27.19 
 
 		 750 aa  75.5  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  29.38 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4129  hypothetical protein  26.35 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  29.14 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2235  hypothetical protein  29.92 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  27.8 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  29.69 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3490  hypothetical protein  30.46 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  29.26 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03510  hypothetical protein  30.2 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3741  ABC transporter permease  29.52 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  32.37 
 
 		 504 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  33.52 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5874  hypothetical protein  31.6 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.138956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5648  hypothetical protein  30.53 
 
 		 518 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6354  putative ABC transporter integral membrane subunit  28.96 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  28.09 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0101  hypothetical protein  21.36 
 
 		 324 aa  57  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.250348 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  32.09 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0713  putative ABC transporter membrane protein  33.01 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00955733  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5875  hypothetical protein  28.39 
 
 		 543 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.191888 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2131  ABC transporter integral membrane protein  27.72 
 
 		 288 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  25.17 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1899  hypothetical protein  30.41 
 
 		 251 aa  49.7  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4256  ABC transporter integral membrane protein  23.35 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1670  hypothetical protein  29.3 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06370  hypothetical protein  24.54 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4498  hypothetical protein  24.67 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.952254  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2000  putative ABC transporter transmembrane protein  27.64 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2844  integral membrane protein  32 
 
 		 280 aa  43.5  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0459878 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1435  putative integral membrane protein  24.81 
 
 		 275 aa  43.5  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.973684  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1805  hypothetical protein  28.36 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0312  hypothetical protein  50 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.228119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7019  hypothetical protein  25.87 
 
 		 257 aa  42.7  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1978  integral membrane protein  30.84 
 
 		 289 aa  42.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02620  hypothetical protein  26.71 
 
 		 328 aa  42.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6408  hypothetical protein  33.64 
 
 		 287 aa  42.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>