64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2645 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  47.83 
 
 		 253 aa  229  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  45.85 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  47.47 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7019  hypothetical protein  50.2 
 
 		 257 aa  172  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  45.24 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  37.05 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  33.2 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  33.2 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  33.2 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0713  putative ABC transporter membrane protein  37.5 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00955733  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  30.53 
 
 		 279 aa  95.5  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  30.8 
 
 		 294 aa  94  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  30.08 
 
 		 272 aa  85.9  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  28.85 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  31.44 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  30.57 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0192  putative ABC transporter membrane protein  35.83 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  35.03 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3741  ABC transporter permease  32.94 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  35.41 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  28.74 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  28.68 
 
 		 276 aa  68.6  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  28.4 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  30.62 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  31.56 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  35.25 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  32.28 
 
 		 271 aa  62  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  31.55 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06370  hypothetical protein  30.29 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  29.68 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  30.06 
 
 		 287 aa  57  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4129  hypothetical protein  33.33 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  31.25 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  28.79 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  32.86 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  30.43 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  27.27 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5648  hypothetical protein  31.12 
 
 		 518 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2000  putative ABC transporter transmembrane protein  39 
 
 		 279 aa  53.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  28.41 
 
 		 293 aa  52.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  33.58 
 
 		 308 aa  52.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  28.66 
 
 		 239 aa  52  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  28.95 
 
 		 504 aa  52  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  25.52 
 
 		 297 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  27.69 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  31.07 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4498  hypothetical protein  28.97 
 
 		 272 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.952254  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1435  putative integral membrane protein  31.96 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.973684  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09550  hypothetical protein  30.57 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  35.29 
 
 		 301 aa  46.2  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  30.17 
 
 		 259 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4256  ABC transporter integral membrane protein  25.93 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0893  hypothetical protein  30.77 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  24.71 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  27.38 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2017  integral membrane protein  35.04 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6251  hypothetical protein  30.08 
 
 		 291 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  26.62 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3689  hypothetical protein  29.95 
 
 		 274 aa  42.4  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03510  hypothetical protein  31.91 
 
 		 302 aa  42.7  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5875  hypothetical protein  40.91 
 
 		 543 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.191888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4069  hypothetical protein  30.4 
 
 		 271 aa  42  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282629  normal  0.0856253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>