64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5616 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  505  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  51.32 
 
 		 256 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2235  hypothetical protein  43.4 
 
 		 255 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  43.35 
 
 		 750 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  35.32 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  35.61 
 
 		 276 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  37.64 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  31.73 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  35.06 
 
 		 272 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  35.74 
 
 		 271 aa  100  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  33.71 
 
 		 276 aa  99.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  33.96 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  33.7 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  29.02 
 
 		 296 aa  92.4  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  31.66 
 
 		 379 aa  88.6  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  32.6 
 
 		 278 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  32.51 
 
 		 297 aa  85.5  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  32.58 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  31.94 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  41.09 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  32.84 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  39.41 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  33.33 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  30.36 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  30.27 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  39.9 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  32.88 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  38.5 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4129  hypothetical protein  32.31 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  27.21 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  31.75 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  29.18 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  28.57 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  32.38 
 
 		 246 aa  62  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  32.38 
 
 		 246 aa  62  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  32.38 
 
 		 246 aa  62  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  33.59 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  32 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1435  putative integral membrane protein  33.09 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.973684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  30.37 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2017  integral membrane protein  32.65 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257608  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2000  putative ABC transporter transmembrane protein  42.45 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0101  hypothetical protein  25.12 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.250348 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  34.62 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  30.22 
 
 		 287 aa  52.4  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  26.94 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  27.65 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6408  hypothetical protein  35.61 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  29.18 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  30.1 
 
 		 251 aa  48.9  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03510  hypothetical protein  39.22 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  31.36 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4256  ABC transporter integral membrane protein  26.92 
 
 		 301 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6354  putative ABC transporter integral membrane subunit  26.79 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06370  hypothetical protein  34.35 
 
 		 265 aa  47  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0419  hypothetical protein  29.59 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0312  hypothetical protein  37.39 
 
 		 252 aa  45.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.228119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5875  hypothetical protein  46.94 
 
 		 543 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.191888 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  29.63 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  29.5 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5648  hypothetical protein  31.16 
 
 		 518 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  44 
 
 		 504 aa  42.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2844  integral membrane protein  35.42 
 
 		 280 aa  42  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0459878 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>