52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6408 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6408  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  523  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  45.39 
 
 		 293 aa  193  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2017  integral membrane protein  46.82 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257608  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  36.75 
 
 		 271 aa  109  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  34.13 
 
 		 276 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  34.11 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  40.1 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  34.68 
 
 		 239 aa  102  6e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  36.32 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  32.58 
 
 		 379 aa  99  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  30.12 
 
 		 272 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  32.47 
 
 		 278 aa  94  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  34.6 
 
 		 294 aa  93.6  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  31.67 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  35.46 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  34.4 
 
 		 256 aa  89  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  32.23 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  31.96 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  32.83 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  32.95 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  34.35 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  38.26 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  29.12 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  34.66 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  26.82 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1435  putative integral membrane protein  35.74 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.973684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  35.61 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  31.88 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  25.45 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6354  putative ABC transporter integral membrane subunit  30.04 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  35.32 
 
 		 750 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  31.42 
 
 		 308 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4129  hypothetical protein  29.91 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0097  hypothetical protein  31.02 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  28.95 
 
 		 271 aa  57  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  30.13 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  36.06 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  31.44 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1899  hypothetical protein  30.13 
 
 		 251 aa  49.3  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  27.72 
 
 		 251 aa  48.9  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  33.67 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0101  hypothetical protein  24.76 
 
 		 324 aa  47.4  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.250348 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  30.85 
 
 		 259 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  33.7 
 
 		 259 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  29.2 
 
 		 246 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  28.57 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  29.37 
 
 		 504 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  35.26 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  29.85 
 
 		 246 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  29.85 
 
 		 246 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  29.85 
 
 		 246 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  26.07 
 
 		 255 aa  42.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>