55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3914 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  100 
 
 		 298 aa  588  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  39.79 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  32.78 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  31.72 
 
 		 276 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  32.25 
 
 		 379 aa  125  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  31.86 
 
 		 277 aa  122  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  30.95 
 
 		 280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  31.67 
 
 		 279 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  33.22 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  32.89 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  30.14 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  31.65 
 
 		 256 aa  109  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  36.36 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  30.9 
 
 		 272 aa  106  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  32.76 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  30.61 
 
 		 271 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  29.29 
 
 		 271 aa  97.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  30.1 
 
 		 272 aa  94  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  32.62 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  33.98 
 
 		 276 aa  90.1  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  33.09 
 
 		 256 aa  89.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  30.1 
 
 		 239 aa  87.8  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  28.04 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2017  integral membrane protein  31.88 
 
 		 310 aa  86.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257608  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  26.37 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  32.23 
 
 		 750 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  29.41 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4129  hypothetical protein  28.45 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  29.72 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  36.62 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  30.48 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  30 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  31.37 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0101  hypothetical protein  26.07 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.250348 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  30.73 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  30.65 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03510  hypothetical protein  29.77 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  35.25 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  36.03 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  36.03 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  36.03 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  28.98 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  27.96 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  26.33 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0713  putative ABC transporter membrane protein  30.89 
 
 		 252 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00955733  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2235  hypothetical protein  27.59 
 
 		 255 aa  52.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  29.61 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6408  hypothetical protein  29.11 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  34.31 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  35.96 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  30.87 
 
 		 504 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3741  ABC transporter permease  28.42 
 
 		 256 aa  49.3  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2000  putative ABC transporter transmembrane protein  29.77 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3689  hypothetical protein  24.52 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0312  hypothetical protein  29.08 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.228119 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>