60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7840 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  100 
 
 		 249 aa  485  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  40.23 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  36.73 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  32.13 
 
 		 379 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  33.2 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  31.68 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  33.7 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  34.6 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  36.61 
 
 		 271 aa  99.4  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  32.2 
 
 		 256 aa  98.6  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  33.6 
 
 		 272 aa  97.1  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  35.03 
 
 		 280 aa  96.3  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  35.56 
 
 		 259 aa  92.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  33.05 
 
 		 278 aa  90.5  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  37.89 
 
 		 272 aa  89.7  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  33.5 
 
 		 293 aa  85.1  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  31.9 
 
 		 750 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  30.88 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  38.33 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  27.74 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  29.8 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  29.73 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  30.05 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  29.51 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4129  hypothetical protein  30.77 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  33.67 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  33.53 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  27.46 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  30.85 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  32.53 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  35.11 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  30.43 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  31.25 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  27.01 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  31.55 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  32.53 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2017  integral membrane protein  35.32 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257608  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  29.21 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2000  putative ABC transporter transmembrane protein  29.82 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  34.52 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1899  hypothetical protein  29.94 
 
 		 251 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  29.03 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  29.17 
 
 		 246 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  29.17 
 
 		 246 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  29.17 
 
 		 246 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6408  hypothetical protein  29.65 
 
 		 287 aa  49.3  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  27.01 
 
 		 251 aa  48.9  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0713  putative ABC transporter membrane protein  38.26 
 
 		 252 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00955733  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03510  hypothetical protein  38.14 
 
 		 302 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  35.11 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2235  hypothetical protein  30.65 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1435  putative integral membrane protein  39.81 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.973684  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1978  integral membrane protein  33.54 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2844  integral membrane protein  49.02 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0459878 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  30.7 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5875  hypothetical protein  42.62 
 
 		 543 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.191888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5874  hypothetical protein  41.3 
 
 		 265 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.138956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  28.77 
 
 		 504 aa  42.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3741  ABC transporter permease  27.88 
 
 		 256 aa  42  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>