73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0257 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  499  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  81.42 
 
 		 253 aa  426  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  50.58 
 
 		 255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  47.83 
 
 		 246 aa  229  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7019  hypothetical protein  52.94 
 
 		 257 aa  199  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  41.92 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  37.2 
 
 		 243 aa  135  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  37.01 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  37.01 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  37.01 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  32.58 
 
 		 279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  30.62 
 
 		 272 aa  99.8  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  30.94 
 
 		 283 aa  99.8  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0713  putative ABC transporter membrane protein  38.38 
 
 		 252 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00955733  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  34.67 
 
 		 294 aa  90.5  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  30.08 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  27.24 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  30.32 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  29.32 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  31.5 
 
 		 271 aa  75.1  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  31.27 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  29.51 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  31.37 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  32.8 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  27.76 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  30.19 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3741  ABC transporter permease  28.15 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  31.41 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  32.41 
 
 		 253 aa  62  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  28.03 
 
 		 276 aa  62  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  35.71 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0192  putative ABC transporter membrane protein  33.73 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  28.63 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  29.67 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06370  hypothetical protein  30.69 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  29.61 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  28.52 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09550  hypothetical protein  31.5 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  27.98 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  30.77 
 
 		 301 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  26.5 
 
 		 297 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  28.96 
 
 		 308 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  28.57 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6251  hypothetical protein  29.29 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  29.03 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4129  hypothetical protein  28.8 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  31.88 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3689  hypothetical protein  30.63 
 
 		 274 aa  49.7  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  29.89 
 
 		 259 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4256  ABC transporter integral membrane protein  28.81 
 
 		 301 aa  48.5  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6354  putative ABC transporter integral membrane subunit  29.17 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  30.12 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1805  hypothetical protein  27.65 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30560  hypothetical protein  30.37 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4498  hypothetical protein  27.18 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.952254  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0893  hypothetical protein  32.35 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  26.87 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2000  putative ABC transporter transmembrane protein  38.32 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  30.66 
 
 		 750 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0750  hypothetical protein  36.17 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18440  hypothetical protein  27.1 
 
 		 265 aa  46.2  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.59801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2235  hypothetical protein  29.15 
 
 		 255 aa  45.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  27.98 
 
 		 293 aa  45.4  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1682  hypothetical protein  28.16 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0419  hypothetical protein  29.02 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  32.67 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  27.27 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  27.4 
 
 		 504 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5875  hypothetical protein  31.97 
 
 		 543 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.191888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5648  hypothetical protein  29.82 
 
 		 518 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1435  putative integral membrane protein  26.85 
 
 		 275 aa  43.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.973684  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0101  hypothetical protein  23.13 
 
 		 324 aa  42.7  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.250348 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>