73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08100 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  523  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  40.31 
 
 
279 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  36.59 
 
 
294 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  40.77 
 
 
276 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  35.56 
 
 
283 aa  148  9e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  35.74 
 
 
271 aa  145  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  35.63 
 
 
379 aa  146  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  38.18 
 
 
278 aa  142  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  37.55 
 
 
292 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  38.66 
 
 
276 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  35.74 
 
 
276 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  36.47 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  34.67 
 
 
280 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  38.33 
 
 
285 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  36.26 
 
 
256 aa  122  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  33.46 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  33.46 
 
 
293 aa  116  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  33.46 
 
 
308 aa  115  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  33.21 
 
 
272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  34.36 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  36.8 
 
 
271 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  34.84 
 
 
239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  30.9 
 
 
298 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  30.62 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  31.1 
 
 
297 aa  92  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  35.47 
 
 
255 aa  92  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  37.89 
 
 
249 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  35.71 
 
 
301 aa  87  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  30.08 
 
 
246 aa  85.9  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  31.31 
 
 
246 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  31.31 
 
 
246 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  31.31 
 
 
246 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2017  integral membrane protein  34.89 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257608  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6354  putative ABC transporter integral membrane subunit  27.82 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  29.5 
 
 
251 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  33.99 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  35.45 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  26.9 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2000  putative ABC transporter transmembrane protein  31.52 
 
 
279 aa  79  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  37.85 
 
 
259 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0101  hypothetical protein  25.68 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.250348 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  33.99 
 
 
287 aa  75.5  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  30.77 
 
 
750 aa  75.5  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4129  hypothetical protein  28.07 
 
 
280 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  30 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  34.12 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  31.3 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  29.32 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03510  hypothetical protein  36.36 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6408  hypothetical protein  30.63 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  32.85 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  28.24 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0713  putative ABC transporter membrane protein  27.98 
 
 
252 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00955733  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  31.91 
 
 
504 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09550  hypothetical protein  30.71 
 
 
272 aa  59.7  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5874  hypothetical protein  33.06 
 
 
265 aa  55.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.138956 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3741  ABC transporter permease  30 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3689  hypothetical protein  23.81 
 
 
274 aa  53.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7019  hypothetical protein  29.12 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4256  ABC transporter integral membrane protein  26.11 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6185  hypothetical protein  35.81 
 
 
264 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  26.59 
 
 
246 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2235  hypothetical protein  31.32 
 
 
255 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  28.08 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1435  putative integral membrane protein  27.97 
 
 
275 aa  45.8  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.973684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0811  hypothetical protein  26.88 
 
 
274 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06370  hypothetical protein  25.35 
 
 
265 aa  43.9  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1670  hypothetical protein  28.99 
 
 
277 aa  43.5  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5875  hypothetical protein  33.64 
 
 
543 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.191888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1899  hypothetical protein  27.97 
 
 
251 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1805  hypothetical protein  27.57 
 
 
269 aa  43.5  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126976  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0312  hypothetical protein  27.78 
 
 
252 aa  42.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.228119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5648  hypothetical protein  30.5 
 
 
518 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>