63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5615 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  481  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  51.32 
 
 		 265 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2235  hypothetical protein  44.57 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  45.37 
 
 		 750 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  35.38 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  34.24 
 
 		 276 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  35.83 
 
 		 277 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 		 379 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  35.16 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  34.77 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  33.85 
 
 		 271 aa  99  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  32.54 
 
 		 271 aa  96.3  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  34.48 
 
 		 276 aa  92.8  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  35.45 
 
 		 272 aa  91.3  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  30.8 
 
 		 296 aa  89.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  30 
 
 		 280 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  30.99 
 
 		 294 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  32.35 
 
 		 272 aa  82  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  33.01 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  33.83 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  31.58 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  30.85 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  30.69 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  29.96 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4129  hypothetical protein  32.8 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  28.88 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  32.6 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  34.16 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  41.73 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  29.23 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  30.19 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  32.08 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2000  putative ABC transporter transmembrane protein  41.35 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  32.71 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2017  integral membrane protein  34.85 
 
 		 310 aa  62  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  34.52 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4256  ABC transporter integral membrane protein  30.61 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  31.05 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  30.97 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  26.63 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  32.57 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  27.38 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  31.78 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  31.78 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  31.78 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6408  hypothetical protein  35.71 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  33.33 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  29 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6354  putative ABC transporter integral membrane subunit  31.13 
 
 		 250 aa  52  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0101  hypothetical protein  23.96 
 
 		 324 aa  50.8  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.250348 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  29.74 
 
 		 504 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  31.38 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0312  hypothetical protein  39.47 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.228119 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1435  putative integral membrane protein  30.62 
 
 		 275 aa  49.3  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.973684  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  29.07 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5875  hypothetical protein  38.55 
 
 		 543 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.191888 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2131  ABC transporter integral membrane protein  31.97 
 
 		 288 aa  45.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0713  putative ABC transporter membrane protein  30.19 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00955733  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0152  hypothetical protein  31.58 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0818034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  29.12 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3490  hypothetical protein  33.6 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  31.58 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03510  hypothetical protein  34.95 
 
 		 302 aa  43.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>