60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03510 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_03510  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  51.43 
 
 		 287 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1978  integral membrane protein  50.18 
 
 		 289 aa  155  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  38.7 
 
 		 278 aa  112  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  31.43 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  30.64 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  30.1 
 
 		 280 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  33.55 
 
 		 276 aa  95.9  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  30.1 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  31.44 
 
 		 278 aa  92.4  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  31.36 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  29.76 
 
 		 279 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03520  hypothetical protein  37.66 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.972538 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  30.64 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  31.49 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  28.29 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  30.39 
 
 		 276 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  28.25 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  29.18 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  34.2 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  31.47 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  28.76 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  37.63 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  35.56 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  34 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  30.23 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  33.51 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  26.97 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  27.96 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  28.93 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  33.86 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2000  putative ABC transporter transmembrane protein  31.03 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  30.85 
 
 		 750 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  32.63 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  40.48 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2844  integral membrane protein  37.09 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0459878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2017  integral membrane protein  32.68 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257608  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  30.34 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  30.34 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  30.34 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  31.11 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  28.88 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  32.4 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0101  hypothetical protein  22.81 
 
 		 324 aa  57  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.250348 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4129  hypothetical protein  25 
 
 		 280 aa  57  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  26.89 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  29.44 
 
 		 246 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  29.1 
 
 		 276 aa  52.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0713  putative ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00955733  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  38.61 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  38.14 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  30.41 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4256  ABC transporter integral membrane protein  26.98 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  29.26 
 
 		 248 aa  49.3  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  29.59 
 
 		 254 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  29.03 
 
 		 259 aa  46.6  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  31.88 
 
 		 504 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  30.18 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3889  hypothetical protein  40 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.972905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3741  ABC transporter permease  29.52 
 
 		 256 aa  42.7  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>