55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4168 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  491  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  39.18 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1805  hypothetical protein  35.14 
 
 		 269 aa  99  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  38.74 
 
 		 248 aa  95.5  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5480  hypothetical protein  34.55 
 
 		 264 aa  95.5  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  decreased coverage  0.00330894 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  34.85 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09550  hypothetical protein  34.78 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06370  hypothetical protein  34.67 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0893  hypothetical protein  32.28 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3689  hypothetical protein  34.05 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4069  hypothetical protein  31.18 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282629  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18440  hypothetical protein  32.23 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.59801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0419  hypothetical protein  31.43 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  28.5 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  29.3 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6251  hypothetical protein  30.17 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30560  hypothetical protein  30.49 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4498  hypothetical protein  32.88 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.952254  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  29.25 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0762  hypothetical protein  34.23 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  29.57 
 
 		 293 aa  57  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  29.61 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  24.87 
 
 		 296 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  26.82 
 
 		 379 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  27.91 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  26.47 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  25.46 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  28.63 
 
 		 297 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  28.11 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  28.09 
 
 		 249 aa  48.9  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  29.32 
 
 		 243 aa  49.3  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  32.06 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  32.06 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0101  hypothetical protein  22.59 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.250348 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  32.06 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6514  putative ABC transporter integral membrane protein  30 
 
 		 272 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.711681  normal  0.0495934 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  26.5 
 
 		 272 aa  45.8  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2733  hypothetical protein  31.72 
 
 		 266 aa  45.4  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.210858  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4256  ABC transporter integral membrane protein  28.78 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0097  hypothetical protein  32.56 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  28.97 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  27.87 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2235  hypothetical protein  30.81 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  31.35 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3741  ABC transporter permease  25.45 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  27.17 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1022  hypothetical protein  25.56 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1322  hypothetical protein  30.92 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  29.33 
 
 		 256 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1682  hypothetical protein  29.96 
 
 		 277 aa  43.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  26.63 
 
 		 298 aa  43.5  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  28.28 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0811  hypothetical protein  31.63 
 
 		 274 aa  42.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4675  hypothetical protein  55.56 
 
 		 245 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  0.238634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  24.8 
 
 		 271 aa  42  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>