24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0893 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0893  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  500  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09550  hypothetical protein  46.32 
 
 		 272 aa  185  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1805  hypothetical protein  41.85 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  37 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5480  hypothetical protein  32.04 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  decreased coverage  0.00330894 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06370  hypothetical protein  30.66 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6251  hypothetical protein  28.22 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  31.25 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  31.79 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4069  hypothetical protein  32.07 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282629  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18440  hypothetical protein  26.96 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.59801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3689  hypothetical protein  30.16 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30560  hypothetical protein  26.59 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  31.5 
 
 		 248 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  29.89 
 
 		 255 aa  49.3  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  32.35 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4256  ABC transporter integral membrane protein  31.2 
 
 		 301 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  26.26 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  25.93 
 
 		 294 aa  46.2  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 		 379 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  30.77 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  26.64 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1682  hypothetical protein  32.64 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  27.23 
 
 		 297 aa  43.5  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>