64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39140 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  498  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  50.58 
 
 		 253 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  49.03 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  47.47 
 
 		 246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7019  hypothetical protein  53.52 
 
 		 257 aa  204  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  35 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  43.27 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  37.86 
 
 		 246 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  37.86 
 
 		 246 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  37.86 
 
 		 246 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  31.42 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  30.88 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0713  putative ABC transporter membrane protein  36.97 
 
 		 252 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00955733  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 		 379 aa  85.5  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  31.82 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  26.57 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  29.78 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  31.37 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  36.5 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  27.72 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  28.41 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06370  hypothetical protein  31.53 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  31.82 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3741  ABC transporter permease  30.66 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  33.99 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  27.82 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  28.68 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  28.46 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  29.57 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  31.47 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0192  putative ABC transporter membrane protein  37.5 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  27 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  30.07 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  28.98 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  27.55 
 
 		 750 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  27.21 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  26.84 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  30.14 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  30.15 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  28.76 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  32.59 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6251  hypothetical protein  30.77 
 
 		 291 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  29.67 
 
 		 256 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  30.41 
 
 		 297 aa  52  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  28.52 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  31.11 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0893  hypothetical protein  29.89 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  31.93 
 
 		 287 aa  49.3  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4498  hypothetical protein  27.73 
 
 		 272 aa  49.3  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.952254  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2000  putative ABC transporter transmembrane protein  37.62 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4129  hypothetical protein  34.48 
 
 		 280 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  28.57 
 
 		 504 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  33.1 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  31.58 
 
 		 301 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3889  hypothetical protein  30.69 
 
 		 294 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.972905 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09550  hypothetical protein  33.63 
 
 		 272 aa  45.4  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30560  hypothetical protein  26.24 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  26.51 
 
 		 251 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4079  hypothetical protein  28.37 
 
 		 305 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.673792  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0312  hypothetical protein  52.08 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.228119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  31.95 
 
 		 254 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1670  hypothetical protein  27.59 
 
 		 277 aa  42.7  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0419  hypothetical protein  28.18 
 
 		 284 aa  42.7  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0811  hypothetical protein  27.68 
 
 		 274 aa  42  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>