23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0419 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0419  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  557  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4498  hypothetical protein  52.59 
 
 		 272 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.952254  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1022  hypothetical protein  50.19 
 
 		 265 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2733  hypothetical protein  39.25 
 
 		 266 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.210858  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1322  hypothetical protein  37.11 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1321  hypothetical protein  40.16 
 
 		 270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0762  hypothetical protein  34.68 
 
 		 265 aa  125  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2471  hypothetical protein  37.89 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000338843  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2511  hypothetical protein  34.93 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0318975  normal  0.937686 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0398  hypothetical protein  36.23 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1600  hypothetical protein  37.02 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5659  hypothetical protein  34.1 
 
 		 264 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4675  hypothetical protein  34.6 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  0.238634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6185  hypothetical protein  30.92 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0127  hypothetical protein  29.18 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  31.43 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  35 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  30.49 
 
 		 253 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  27.46 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  27.98 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  28.18 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  28.69 
 
 		 296 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  29.37 
 
 		 297 aa  42.7  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>