19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1321 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1321  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  526  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1322  hypothetical protein  58.74 
 
 
271 aa  310  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4498  hypothetical protein  41.9 
 
 
272 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.952254  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2733  hypothetical protein  42.37 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.210858  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1022  hypothetical protein  38.8 
 
 
265 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0419  hypothetical protein  39.31 
 
 
284 aa  170  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0762  hypothetical protein  40.96 
 
 
265 aa  160  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5659  hypothetical protein  42.18 
 
 
264 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2511  hypothetical protein  32.22 
 
 
264 aa  116  5e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0318975  normal  0.937686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6185  hypothetical protein  36.47 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2471  hypothetical protein  38 
 
 
255 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000338843  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0398  hypothetical protein  36.84 
 
 
261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1600  hypothetical protein  36.84 
 
 
261 aa  112  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4675  hypothetical protein  32.68 
 
 
245 aa  89.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  0.238634 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0127  hypothetical protein  29.77 
 
 
258 aa  50.4  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  33.1 
 
 
260 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  27.7 
 
 
253 aa  45.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  28.89 
 
 
251 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3490  hypothetical protein  26.25 
 
 
274 aa  43.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>