21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1022 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1022  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  524  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4498  hypothetical protein  49.08 
 
 
272 aa  261  6e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.952254  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0419  hypothetical protein  50.19 
 
 
284 aa  236  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1321  hypothetical protein  38.8 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2733  hypothetical protein  36.06 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.210858  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1322  hypothetical protein  32.93 
 
 
271 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0762  hypothetical protein  34.66 
 
 
265 aa  128  9.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2471  hypothetical protein  36.99 
 
 
255 aa  125  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000338843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5659  hypothetical protein  32.93 
 
 
264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0398  hypothetical protein  37.5 
 
 
261 aa  108  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1600  hypothetical protein  36.69 
 
 
261 aa  105  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4675  hypothetical protein  32.26 
 
 
245 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  0.238634 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2511  hypothetical protein  29.92 
 
 
264 aa  101  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0318975  normal  0.937686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6185  hypothetical protein  27.95 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0127  hypothetical protein  27.27 
 
 
258 aa  72  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  35.16 
 
 
249 aa  55.8  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  26.89 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  26.89 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  26.89 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  38.1 
 
 
260 aa  42.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1805  hypothetical protein  26.11 
 
 
269 aa  42  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126976  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>