23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2511 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2511  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  513  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0318975  normal  0.937686 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0762  hypothetical protein  39.02 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2733  hypothetical protein  34.05 
 
 
266 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.210858  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6185  hypothetical protein  38.55 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0398  hypothetical protein  38.06 
 
 
261 aa  126  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1600  hypothetical protein  37.69 
 
 
261 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1322  hypothetical protein  32.17 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0419  hypothetical protein  34.69 
 
 
284 aa  116  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4675  hypothetical protein  38.91 
 
 
245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  0.238634 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5659  hypothetical protein  34.92 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1022  hypothetical protein  31.35 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1321  hypothetical protein  33.33 
 
 
270 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2471  hypothetical protein  32.16 
 
 
255 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000338843  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4498  hypothetical protein  28.79 
 
 
272 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.952254  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  36.46 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3490  hypothetical protein  32.08 
 
 
274 aa  47.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  34.29 
 
 
243 aa  46.2  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0127  hypothetical protein  28.35 
 
 
258 aa  46.2  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  32.87 
 
 
246 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  28.02 
 
 
253 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  26.85 
 
 
253 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  23.98 
 
 
297 aa  42  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  30.56 
 
 
278 aa  42.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>