18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0398 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0398  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  495  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1600  hypothetical protein  96.93 
 
 
261 aa  394  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2733  hypothetical protein  41.22 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.210858  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2471  hypothetical protein  50.39 
 
 
255 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000338843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5659  hypothetical protein  45.98 
 
 
264 aa  158  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1022  hypothetical protein  37.5 
 
 
265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4498  hypothetical protein  37.41 
 
 
272 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.952254  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0419  hypothetical protein  36.23 
 
 
284 aa  145  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2511  hypothetical protein  38.81 
 
 
264 aa  142  7e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0318975  normal  0.937686 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1322  hypothetical protein  37.4 
 
 
271 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0762  hypothetical protein  41.32 
 
 
265 aa  135  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6185  hypothetical protein  37.97 
 
 
264 aa  126  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1321  hypothetical protein  36.84 
 
 
270 aa  125  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4675  hypothetical protein  38.91 
 
 
245 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  0.238634 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0127  hypothetical protein  31.3 
 
 
258 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  36.96 
 
 
260 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  34.22 
 
 
253 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  34.08 
 
 
287 aa  45.8  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0434218 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>