17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6185 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6185  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  502  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2511  hypothetical protein  36.96 
 
 
264 aa  123  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0318975  normal  0.937686 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2733  hypothetical protein  32.12 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.210858  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0762  hypothetical protein  36.51 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1322  hypothetical protein  34.16 
 
 
271 aa  106  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1600  hypothetical protein  38.72 
 
 
261 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4498  hypothetical protein  30.5 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.952254  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1321  hypothetical protein  37.11 
 
 
270 aa  95.9  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0398  hypothetical protein  38.35 
 
 
261 aa  95.5  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5659  hypothetical protein  35.21 
 
 
264 aa  92.8  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2471  hypothetical protein  35.66 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000338843  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1022  hypothetical protein  28.35 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0419  hypothetical protein  30.92 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4675  hypothetical protein  43.88 
 
 
245 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  0.238634 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  35.81 
 
 
272 aa  50.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  28.7 
 
 
296 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  30.31 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>