26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4498 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4498  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  539  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.952254  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1022  hypothetical protein  49.08 
 
 
265 aa  260  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0419  hypothetical protein  52.59 
 
 
284 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1322  hypothetical protein  40.87 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1321  hypothetical protein  41.9 
 
 
270 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2733  hypothetical protein  38.87 
 
 
266 aa  169  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.210858  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0762  hypothetical protein  33.86 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2471  hypothetical protein  37.85 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000338843  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1600  hypothetical protein  37.04 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0398  hypothetical protein  37.41 
 
 
261 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5659  hypothetical protein  32.93 
 
 
264 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4675  hypothetical protein  33.97 
 
 
245 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  0.238634 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2511  hypothetical protein  28.79 
 
 
264 aa  89.4  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0318975  normal  0.937686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6185  hypothetical protein  30.68 
 
 
264 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0127  hypothetical protein  29.22 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  32.17 
 
 
260 aa  56.2  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  28.97 
 
 
246 aa  49.7  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  27.73 
 
 
255 aa  49.7  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  28.24 
 
 
243 aa  49.3  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  29.81 
 
 
253 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  27.18 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  24.88 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  32.76 
 
 
246 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1805  hypothetical protein  25.45 
 
 
269 aa  43.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126976  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  24.19 
 
 
280 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02620  hypothetical protein  31.71 
 
 
328 aa  42  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>