65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4386 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  476  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  37.2 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  34.87 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  37.01 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  41.5 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  36.15 
 
 		 255 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0713  putative ABC transporter membrane protein  37.8 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00955733  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  35.08 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  35.08 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  35.08 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7019  hypothetical protein  35.71 
 
 		 257 aa  98.6  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  29.62 
 
 		 283 aa  92.8  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0192  putative ABC transporter membrane protein  34.68 
 
 		 252 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3741  ABC transporter permease  29.88 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  32.3 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  31.52 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  29.32 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  30.37 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  32.74 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  30.47 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  29.41 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  29.8 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  32.84 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  33.56 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  28.7 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4315  hypothetical protein  28.46 
 
 		 272 aa  71.6  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.356947  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  30.73 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  35.24 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  28.57 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  28.57 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  29.52 
 
 		 292 aa  62  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  26.46 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06370  hypothetical protein  31.51 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  28.34 
 
 		 504 aa  58.9  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2017  integral membrane protein  33.1 
 
 		 310 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257608  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  31.75 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  31.03 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  30.87 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5875  hypothetical protein  47.37 
 
 		 543 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.191888 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4498  hypothetical protein  27.14 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.952254  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  31.74 
 
 		 287 aa  52.8  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  28.64 
 
 		 271 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  30.73 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  29.38 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4408  hypothetical protein  29.5 
 
 		 263 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  30.99 
 
 		 249 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0750  hypothetical protein  29.45 
 
 		 269 aa  49.3  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1435  putative integral membrane protein  28.63 
 
 		 275 aa  48.5  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.973684  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  26.2 
 
 		 297 aa  48.9  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  27.15 
 
 		 301 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2733  hypothetical protein  28.11 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.210858  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  29.95 
 
 		 750 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  26.77 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  28.72 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  27.65 
 
 		 293 aa  45.8  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  28.81 
 
 		 285 aa  45.8  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  35.24 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6514  putative ABC transporter integral membrane protein  32.39 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.711681  normal  0.0495934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  36.73 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0419  hypothetical protein  26.46 
 
 		 284 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2000  putative ABC transporter transmembrane protein  35.29 
 
 		 279 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  25.87 
 
 		 308 aa  42.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6408  hypothetical protein  30.13 
 
 		 287 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5648  hypothetical protein  36.75 
 
 		 518 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>