63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7019 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7019  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  500  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  52.94 
 
 		 253 aa  252  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  50.98 
 
 		 253 aa  248  9e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  53.52 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  50.2 
 
 		 246 aa  218  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  43.73 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  34.09 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  37.75 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  37.75 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  37.75 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0713  putative ABC transporter membrane protein  39.23 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00955733  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  28.2 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  30.62 
 
 		 379 aa  89.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  29.5 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0192  putative ABC transporter membrane protein  42.63 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  33.7 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  30.77 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  25.87 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  29.92 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  31.14 
 
 		 292 aa  75.5  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06370  hypothetical protein  33.17 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  32.37 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  29.28 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  27.38 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  32.98 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  30.94 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  30.65 
 
 		 239 aa  62  0.000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  34.78 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3741  ABC transporter permease  29.43 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  28.46 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  26.59 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  30.65 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  28.2 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  30.26 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6251  hypothetical protein  32.34 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4498  hypothetical protein  29.91 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.952254  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  27.7 
 
 		 298 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  31.25 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  29.33 
 
 		 750 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  31.11 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0419  hypothetical protein  30.32 
 
 		 284 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  25.18 
 
 		 296 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4069  hypothetical protein  30 
 
 		 271 aa  49.3  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282629  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  28.87 
 
 		 265 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  26.3 
 
 		 271 aa  48.9  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  23.61 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30560  hypothetical protein  28.57 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0893  hypothetical protein  28.86 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0101  hypothetical protein  22.48 
 
 		 324 aa  46.6  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.250348 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  30.77 
 
 		 287 aa  46.6  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09550  hypothetical protein  30 
 
 		 272 aa  46.2  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4129  hypothetical protein  34.95 
 
 		 280 aa  46.2  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  28.57 
 
 		 308 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1022  hypothetical protein  28.68 
 
 		 265 aa  45.8  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  26.02 
 
 		 293 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  31.87 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1805  hypothetical protein  27.78 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2235  hypothetical protein  28.71 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4256  ABC transporter integral membrane protein  31.11 
 
 		 301 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5480  hypothetical protein  30.41 
 
 		 264 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  decreased coverage  0.00330894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4408  hypothetical protein  27.95 
 
 		 263 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2511  hypothetical protein  29.41 
 
 		 264 aa  42  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0318975  normal  0.937686 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2017  integral membrane protein  31.76 
 
 		 310 aa  42  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>