49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0713 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0713  putative ABC transporter membrane protein  100 
 
 		 252 aa  485  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00955733  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0192  putative ABC transporter membrane protein  74.5 
 
 		 252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  52.85 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  52.85 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  52.85 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  35.18 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  36.22 
 
 		 253 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  37.5 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  33.46 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  38.05 
 
 		 249 aa  99.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  36.97 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7019  hypothetical protein  39.23 
 
 		 257 aa  89.7  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  29.7 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3741  ABC transporter permease  29.64 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  32.74 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  28.68 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  32.66 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  30.84 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  33.66 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06370  hypothetical protein  33.18 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  32.69 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  30.52 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  35.71 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4129  hypothetical protein  28.64 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  30.5 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  32.57 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  35.08 
 
 		 285 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6354  putative ABC transporter integral membrane subunit  31.16 
 
 		 250 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09550  hypothetical protein  32.16 
 
 		 272 aa  52  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  29.59 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  29.27 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  24.71 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  28.71 
 
 		 297 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  30.88 
 
 		 278 aa  49.7  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4315  hypothetical protein  29.41 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.356947  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  31.82 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  27.38 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4069  hypothetical protein  31.72 
 
 		 271 aa  46.2  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282629  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  31.44 
 
 		 239 aa  46.2  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  29.62 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  28.02 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  31.47 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  27.32 
 
 		 271 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1805  hypothetical protein  29.33 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30560  hypothetical protein  32.19 
 
 		 297 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1670  hypothetical protein  30.52 
 
 		 277 aa  43.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  29.21 
 
 		 271 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03510  hypothetical protein  34.38 
 
 		 302 aa  42  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>