55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0192 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0192  putative ABC transporter membrane protein  100 
 
 
252 aa  478  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0713  putative ABC transporter membrane protein  74.5 
 
 
252 aa  325  6e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00955733  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  50.61 
 
 
246 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  50.61 
 
 
246 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  50.61 
 
 
246 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  36.29 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  34.84 
 
 
246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  38 
 
 
249 aa  105  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  33.47 
 
 
253 aa  104  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  34.9 
 
 
253 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7019  hypothetical protein  42.63 
 
 
257 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  38 
 
 
255 aa  99  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  31.03 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 
379 aa  75.5  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3741  ABC transporter permease  28.9 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  31.86 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  31.22 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  30.89 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  32.49 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  29.3 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06370  hypothetical protein  33.79 
 
 
265 aa  64.7  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  27.83 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  30.34 
 
 
297 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4315  hypothetical protein  30.09 
 
 
272 aa  60.1  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.356947  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  34.78 
 
 
253 aa  58.9  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  32.18 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  31.05 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  26.04 
 
 
276 aa  55.5  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  30.63 
 
 
239 aa  55.5  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  27.72 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  29.93 
 
 
283 aa  53.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  30.68 
 
 
271 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  28.12 
 
 
272 aa  52.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4129  hypothetical protein  28.03 
 
 
280 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  32.26 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  28.57 
 
 
271 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  31.62 
 
 
298 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  27.6 
 
 
271 aa  49.3  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0750  hypothetical protein  35.15 
 
 
269 aa  49.3  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  32.75 
 
 
287 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03510  hypothetical protein  36.63 
 
 
302 aa  46.6  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  28.68 
 
 
278 aa  45.4  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  27.14 
 
 
750 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5874  hypothetical protein  39.78 
 
 
265 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.138956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  32.71 
 
 
254 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4069  hypothetical protein  28.04 
 
 
271 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282629  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  30.1 
 
 
246 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  32.77 
 
 
278 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6354  putative ABC transporter integral membrane subunit  34.34 
 
 
250 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  26.39 
 
 
292 aa  43.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30560  hypothetical protein  26.57 
 
 
297 aa  43.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  29.5 
 
 
259 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5875  hypothetical protein  52 
 
 
543 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.191888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  34.48 
 
 
504 aa  42.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  25.4 
 
 
248 aa  42  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.129253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>