14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6514 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6514  putative ABC transporter integral membrane protein  100 
 
 		 272 aa  519  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.711681  normal  0.0495934 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0362  hypothetical protein  30.42 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5296  hypothetical protein  30.23 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4121  hypothetical protein  32.6 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1174  hypothetical protein  26.97 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.914249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  28.57 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1670  hypothetical protein  25.53 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0811  hypothetical protein  27.45 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4079  hypothetical protein  27.7 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.673792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  32.3 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  30.26 
 
 		 253 aa  47  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  31.34 
 
 		 243 aa  45.4  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  29.54 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  30.61 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>