13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5296 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5296  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  497  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1174  hypothetical protein  62.84 
 
 		 261 aa  245  4e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.914249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0362  hypothetical protein  41.97 
 
 		 261 aa  115  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6514  putative ABC transporter integral membrane protein  32.58 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.711681  normal  0.0495934 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4121  hypothetical protein  28.79 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0811  hypothetical protein  28.92 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  33.98 
 
 		 276 aa  48.9  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02620  hypothetical protein  26.44 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  32.09 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3371  bacitracin transport permease; ABC transporter, permease  24.1 
 
 		 314 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0164571  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3420  bacitracin transport permease; ABC transporter, permease component  24.62 
 
 		 314 aa  42.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000072807  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  28.3 
 
 		 279 aa  42.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3699  hypothetical protein  24.1 
 
 		 314 aa  42  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>