64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2674 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  560  1.0000000000000001e-159  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  40.64 
 
 
294 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  37.55 
 
 
272 aa  156  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  37.28 
 
 
276 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  35.84 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  35.87 
 
 
276 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  36.07 
 
 
279 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  36.75 
 
 
283 aa  132  6.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  32.98 
 
 
379 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  35.31 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  34.06 
 
 
271 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  34.51 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  33.1 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  33.61 
 
 
285 aa  109  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  34.3 
 
 
277 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  32.04 
 
 
280 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  29.64 
 
 
278 aa  105  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  29.79 
 
 
293 aa  102  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  36.36 
 
 
271 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  39.66 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  30.63 
 
 
253 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  33.69 
 
 
276 aa  94.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  28.04 
 
 
298 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  30.96 
 
 
253 aa  92.8  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  29 
 
 
296 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  28.99 
 
 
297 aa  85.9  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  28.99 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  32.98 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  26.54 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2017  integral membrane protein  32.94 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257608  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  31.56 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0101  hypothetical protein  26.47 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.250348 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  28.65 
 
 
249 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4129  hypothetical protein  29.76 
 
 
280 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  28.67 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2000  putative ABC transporter transmembrane protein  38.86 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  30.71 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  27.64 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  28.78 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  28.42 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6354  putative ABC transporter integral membrane subunit  28.09 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  32.67 
 
 
246 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  32.67 
 
 
246 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  32.67 
 
 
246 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  28.57 
 
 
243 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  28.62 
 
 
246 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  27.86 
 
 
750 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  34.48 
 
 
254 aa  62.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03510  hypothetical protein  30.45 
 
 
302 aa  60.8  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  27.39 
 
 
251 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6408  hypothetical protein  33.33 
 
 
287 aa  59.3  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7019  hypothetical protein  31.14 
 
 
257 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  38.61 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  34.78 
 
 
504 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1978  integral membrane protein  33.95 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1899  hypothetical protein  33.06 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  27.31 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5648  hypothetical protein  29.59 
 
 
518 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  28.43 
 
 
253 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4256  ABC transporter integral membrane protein  29.47 
 
 
301 aa  46.2  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2844  integral membrane protein  30.33 
 
 
280 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0459878 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1322  hypothetical protein  24.15 
 
 
271 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09550  hypothetical protein  30.66 
 
 
272 aa  42.7  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1022  hypothetical protein  24.55 
 
 
265 aa  42.4  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>