34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0101 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0101  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  652    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.250348 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  27.84 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  25.34 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  25.08 
 
 		 283 aa  72.4  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  27.01 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  26.46 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  25.08 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  21.36 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  24.83 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  26.14 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  27.18 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  24.75 
 
 		 279 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  23.96 
 
 		 256 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  26.05 
 
 		 265 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  26.94 
 
 		 750 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  23.64 
 
 		 285 aa  53.1  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  23.98 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  22.49 
 
 		 251 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  22.5 
 
 		 276 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  31.45 
 
 		 259 aa  49.7  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  26.5 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  24.41 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  27.03 
 
 		 278 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  24.58 
 
 		 272 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  28 
 
 		 276 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  22.92 
 
 		 277 aa  46.2  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2235  hypothetical protein  25.85 
 
 		 255 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  25.62 
 
 		 239 aa  45.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  23.87 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2017  integral membrane protein  22.88 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257608  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  23.36 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  22.71 
 
 		 253 aa  43.9  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30560  hypothetical protein  22.32 
 
 		 297 aa  42.7  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6354  putative ABC transporter integral membrane subunit  30.95 
 
 		 250 aa  43.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>