17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1322 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1322  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  525  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1321  hypothetical protein  58.74 
 
 
270 aa  277  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2733  hypothetical protein  40.67 
 
 
266 aa  179  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.210858  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4498  hypothetical protein  40.87 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.952254  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0419  hypothetical protein  37.11 
 
 
284 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1022  hypothetical protein  32.93 
 
 
265 aa  149  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0762  hypothetical protein  39.44 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5659  hypothetical protein  34.7 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2511  hypothetical protein  32.17 
 
 
264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0318975  normal  0.937686 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1600  hypothetical protein  36.9 
 
 
261 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0398  hypothetical protein  37.4 
 
 
261 aa  105  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6185  hypothetical protein  34.16 
 
 
264 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2471  hypothetical protein  35.08 
 
 
255 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000338843  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4675  hypothetical protein  37.5 
 
 
245 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  0.238634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  30.38 
 
 
276 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4069  hypothetical protein  31.85 
 
 
271 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282629  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  52.38 
 
 
253 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>