21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2471 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2471  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  477  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000338843  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0398  hypothetical protein  49.8 
 
 
261 aa  161  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1600  hypothetical protein  50 
 
 
261 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5659  hypothetical protein  46.72 
 
 
264 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4498  hypothetical protein  37.85 
 
 
272 aa  143  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.952254  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1022  hypothetical protein  36.99 
 
 
265 aa  142  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0762  hypothetical protein  42.28 
 
 
265 aa  142  7e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2733  hypothetical protein  37.8 
 
 
266 aa  141  9e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.210858  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0419  hypothetical protein  40.47 
 
 
284 aa  136  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1322  hypothetical protein  36.29 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1321  hypothetical protein  39.36 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2511  hypothetical protein  33.73 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0318975  normal  0.937686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6185  hypothetical protein  35.66 
 
 
264 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4675  hypothetical protein  40.73 
 
 
245 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  0.238634 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  32.77 
 
 
246 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  32.77 
 
 
246 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  32.77 
 
 
246 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4069  hypothetical protein  33.06 
 
 
271 aa  45.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282629  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  39.66 
 
 
260 aa  43.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3490  hypothetical protein  30.6 
 
 
274 aa  43.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09550  hypothetical protein  35.14 
 
 
272 aa  42  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.600151 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>